#This file conatins TSC SNPs mapped on to repeat regions in Chr22. Repeats were identified using RepeatMasker2 #SNP positions are relative to chromosomal coordinates snpid repeatstart repeatend snppos repeat_type repeat_class 656 9467950 9469159 9468013 L1MDa LINE/L1 734 18835463 18836344 18835475 L1MA6 LINE/L1 735 18835463 18836344 18835508 L1MA6 LINE/L1 992 21037487 21037872 21037501 THE1C LTR/MaLR 1082 5969508 5969941 5969536 L1M4 LINE/L1 1536 13081381 13081500 13081404 MIR SINE/MIR 1537 13081625 13081744 13081683 MIR SINE/MIR 1597 1103583 1103892 1103861 AluSx SINE/Alu 1650 18409167 18409490 18409195 MER41B LTR/ERV1 1651 18409167 18409490 18409352 MER41B LTR/ERV1 1705 32964201 32964306 32964293 THE1B-int LTR/MaLR 1706 32964080 32964205 32964092 THE1B-int LTR/MaLR 1707 32964201 32964306 32964257 THE1B-int LTR/MaLR 1708 32964201 32964306 32964273 THE1B-int LTR/MaLR 1709 32964201 32964306 32964287 THE1B-int LTR/MaLR 1710 32963737 32964079 32963957 THE1B LTR/MaLR 1711 32963737 32964079 32964064 THE1B LTR/MaLR 1813 4443137 4443435 4443244 AluJb SINE/Alu 1814 4443499 4443649 4443524 L2 LINE/L2 2333 24205319 24206180 24206097 L2 LINE/L2 2334 20360278 20360586 20360288 AluY SINE/Alu 2337 17240735 17240916 17240913 MIR SINE/MIR 2338 12109206 12109710 12109301 L1MA6 LINE/L1 2343 28842502 28842766 28842746 L1MB8 LINE/L1 2347 17231382 17231685 17231384 AluY SINE/Alu 2357 9010879 9010956 9010916 MIR SINE/MIR 2359 18408328 18409094 18408554 MER66-int LTR/ERV1 2361 17051696 17051906 17051867 L1MD2 LINE/L1 2366 31727217 31727256 31727228 AT_rich Low_complexity 2368 18991960 18992309 18992298 AluSx SINE/Alu 2371 12820938 12821239 12820952 AluJb SINE/Alu 2374 2099992 2100109 2100107 BC200 scRNA 2381 2998808 2999099 2999020 AluSx SINE/Alu 2384 17458431 17458666 17458462 MIR SINE/MIR 2386 12198324 12198687 12198405 THE1B LTR/MaLR 2389 11014472 11014656 11014518 MIR3 SINE/MIR 2393 9210608 9210913 9210762 AluY SINE/Alu 2395 18915090 18915200 18915150 L2 LINE/L2 2396 2899090 2899653 2899633 L1ME LINE/L1 2397 16187230 16187601 16187242 L1ME LINE/L1 2400 18803278 18803982 18803579 MER21A LTR/ERV1 2405 2998808 2999099 2998885 AluSx SINE/Alu 2407 28194693 28195007 28194783 AluJb SINE/Alu 2420 20257979 20258109 20258109 L2 LINE/L2 2423 6248077 6248368 6248228 AluSc SINE/Alu 2425 18631196 18631652 18631641 LTR33 LTR/ERVL 2429 18915197 18915340 18915215 L2 LINE/L2 2431 28194513 28194692 28194633 MLT1C LTR/MaLR 2432 9210608 9210913 9210892 AluY SINE/Alu 2452 21876285 21876570 21876336 L2 LINE/L2 2456 19923045 19923387 19923186 MLT1K LTR/MaLR 2473 19104080 19104377 19104207 AluJo SINE/Alu 2482 29351761 29351812 29351780 L1MB4 LINE/L1 2492 28931537 28931844 28931815 AluSq SINE/Alu 2497 13049379 13049703 13049545 L1PB1 LINE/L1 2498 19102763 19103074 19102835 AluY SINE/Alu 2515 10760646 10760936 10760869 L2 LINE/L2 2520 10827848 10828097 10827962 AluSg SINE/Alu 2527 34472122 34472380 34472304 MLT1K LTR/MaLR 2539 10760646 10760936 10760808 L2 LINE/L2 2548 19383630 19383959 19383712 AluSx SINE/Alu 2549 10827848 10828097 10827976 AluSg SINE/Alu 2550 6490605 6491169 6490722 L2 LINE/L2 2555 13282020 13282240 13282052 L1MC/D LINE/L1 2556 32922820 32923633 32922836 L1ME1 LINE/L1 2564 6490605 6491169 6490652 L2 LINE/L2 2566 16186915 16187192 16187038 AluSp SINE/Alu 2568 18144798 18144910 18144805 MIR SINE/MIR 2573 18849359 18849543 18849514 MIR SINE/MIR 2579 10382115 10382417 10382263 AluSx SINE/Alu 2580 14548425 14548717 14548699 AluSq SINE/Alu 2583 28050682 28050817 28050747 AluSq/x SINE/Alu 2584 27090968 27091121 27091039 MIR SINE/MIR 2588 5858032 5858581 5858135 L1MC4a LINE/L1 2594 6490605 6491169 6490906 L2 LINE/L2 2602 20538325 20538476 20538413 MLT1H LTR/MaLR 2611 28256678 28259029 28257333 L1MC3 LINE/L1 2620 28256678 28259029 28257420 L1MC3 LINE/L1 2624 2896290 2896407 2896386 MER20 DNA/MER1_type 2625 18603476 18603761 18603566 AluSx SINE/Alu 2627 9382050 9382393 9382193 LTR14A LTR/ERVK 2634 16315560 16315842 16315722 AluJo SINE/Alu 2637 9077476 9077552 9077552 MIR SINE/MIR 2638 10222768 10223059 10222776 L2 LINE/L2 2664 30863784 30864115 30864072 MLT2D LTR/ERVL 2722 16108805 16109999 16109173 L1MC5 LINE/L1 2753 13610769 13611102 13611033 L1MC4a LINE/L1 2763 20649605 20649826 20649673 AluY SINE/Alu 2774 19016573 19016705 19016697 MIR3 SINE/MIR 2782 2145306 2145351 2145349 (TG)n Simple_repeat 2784 19170326 19170365 19170357 L2 LINE/L2 2798 28050682 28050817 28050810 AluSq/x SINE/Alu 2818 9382050 9382393 9382354 LTR14A LTR/ERVK 2824 10795179 10795697 10795194 MLT1H LTR/MaLR 2826 26804828 26804875 26804863 MIR SINE/MIR 2988 29239713 29240378 29240200 LTR9 LTR/ERV1 2989 29239713 29240378 29240032 LTR9 LTR/ERV1 3270 4443137 4443435 4443159 AluJb SINE/Alu 3286 26374915 26375203 26375123 AluSp SINE/Alu 3492 9449445 9449672 9449656 MLT1K LTR/MaLR 3696 9935009 9935393 9935341 MLT1K LTR/MaLR 3698 10902180 10902717 10902611 MLT1K LTR/MaLR 3699 20342148 20342329 20342153 AluSc SINE/Alu 3716 30715248 30715331 30715329 MIR SINE/MIR 3717 16108805 16109999 16109186 L1MC5 LINE/L1 3720 16108805 16109999 16109271 L1MC5 LINE/L1 3721 18255536 18256013 18255911 L1ME3A LINE/L1 3727 11646957 11647343 11647022 L2 LINE/L2 3729 17052599 17052907 17052900 AluSx SINE/Alu 3732 17293313 17293615 17293513 AluY SINE/Alu 3756 20091972 20092248 20092011 MER77 LTR/ERV1 3758 14080439 14080707 14080533 MIR SINE/MIR 3766 7079724 7079843 7079758 L1ME LINE/L1 3790 16737170 16737500 16737313 L2 LINE/L2 3795 20341993 20342120 20342055 MER117 DNA/MER1_type 3796 15828397 15828513 15828404 AluSq/x SINE/Alu 3802 29707988 29708044 29708027 (CA)n Simple_repeat 3819 33891390 33891647 33891417 L1M4 LINE/L1 3826 31313073 31313425 31313168 MLT1A1 LTR/MaLR 3827 9136132 9136440 9136262 AluJb SINE/Alu 3850 31432270 31432565 31432435 AluSx SINE/Alu 3853 7078725 7079020 7078941 AluSp SINE/Alu 3860 9477690 9477861 9477845 MLT1I LTR/MaLR 3862 23988727 23989049 23988760 AluSx SINE/Alu 3875 10872163 10872333 10872171 GA-rich Low_complexity 3879 19998516 19998820 19998807 AluSp SINE/Alu 3881 11014472 11014656 11014618 MIR3 SINE/MIR 3888 21545624 21545784 21545781 L1MC1 LINE/L1 3889 8526604 8526753 8526668 MIR SINE/MIR 3891 21545793 21546091 21545857 AluSx SINE/Alu 3910 16826967 16827367 16827253 L1MEd LINE/L1 3921 7078725 7079020 7078981 AluSp SINE/Alu 3925 31313073 31313425 31313110 MLT1A1 LTR/MaLR 3940 26969903 26970201 26970154 AluSx SINE/Alu 3951 16317054 16317101 16317094 MIR SINE/MIR 3965 31313073 31313425 31313252 MLT1A1 LTR/MaLR 3971 16783932 16784229 16784165 AluSx SINE/Alu 4000 9382050 9382393 9382379 LTR14A LTR/ERVK 4007 9181058 9181341 9181089 AluJo SINE/Alu 4015 27710304 27710377 27710367 MER20 DNA/MER1_type 4021 13259043 13259302 13259291 AluSq SINE/Alu 4026 21485473 21485642 21485517 MLT1L LTR/MaLR 4031 17924167 17924342 17924302 CT-rich Low_complexity 4043 28461599 28461877 28461690 AluSx SINE/Alu 4047 18256015 18256419 18256053 Tigger2a DNA/MER2_type 4049 9332875 9332987 9332970 MER58B DNA/MER1_type 4050 9038787 9039140 9038950 L2 LINE/L2 4053 18972146 18972280 18972258 L2 LINE/L2 4056 9828184 9828925 9828711 L1M4c LINE/L1 4061 17753423 17753729 17753487 AluY SINE/Alu 4065 22722766 22722986 22722950 MER4D-int LTR/ERV1 4067 15110263 15110401 15110329 MIR3 SINE/MIR 4069 26758432 26758568 26758468 MIR SINE/MIR 4071 13023240 13024408 13024067 L2 LINE/L2 4072 10767493 10767535 10767511 G-rich Low_complexity 4073 22618725 22618812 22618805 L3 LINE/CR1 4079 14093284 14093589 14093553 AluY SINE/Alu 4081 28461501 28461598 28461573 L2 LINE/L2 4090 20726754 20727915 20727766 L1PA16 LINE/L1 4093 32982314 32982697 32982453 L1MC4a LINE/L1 4095 21960612 21960917 21960865 AluSq SINE/Alu 4098 31995130 31995322 31995157 MER20 DNA/MER1_type 4099 19301982 19302051 19301993 MIR SINE/MIR 4100 22703996 22704271 22704053 AluSx SINE/Alu 4101 18921880 18922177 18922170 AluSx SINE/Alu 4106 31205869 31206287 31206250 MSTB LTR/MaLR 4112 19293935 19294237 19294156 AluSg SINE/Alu 4121 33459258 33460919 33460798 pTR5 LTR/ERV1 4122 23746823 23747092 23747040 MER33 DNA/MER1_type 4125 3156473 3156611 3156508 PABL_B-int LTR/ERV1 4134 19293935 19294237 19294185 AluSg SINE/Alu 4140 12898720 12899249 12898928 REP3 LTR/ERV 4142 29361359 29361759 29361504 L2 LINE/L2 4151 11040082 11040594 11040199 MLT1K LTR/MaLR 4159 28090612 28090749 28090727 MLT2E LTR/ERVL 4161 14569942 14570048 14569966 MIR SINE/MIR 4162 33179520 33180921 33180873 L1ME3A LINE/L1 4174 22953156 22953621 22953286 MLT1F LTR/MaLR 4176 3156128 3156447 3156368 AluSx SINE/Alu 4179 20927042 20927349 20927277 AluSx SINE/Alu 4189 9410135 9410297 9410226 L1M1 LINE/L1 4192 10994576 10994633 10994598 (TATATG)n Simple_repeat 4205 25569172 25569382 25569333 MIR SINE/MIR 4213 26842787 26843092 26842797 AluSq SINE/Alu 4214 16465689 16465738 16465716 (TCCC)n Simple_repeat 4225 26300799 26301110 26301102 AluSq SINE/Alu 4230 16720823 16721034 16720941 L1ME4a LINE/L1 4233 32303476 32303736 32303589 (AGGTG)n Simple_repeat 4239 31254432 31255120 31255089 L1MCb LINE/L1 4242 3293100 3293344 3293306 L1MB3 LINE/L1 4243 32303476 32303736 32303657 (AGGTG)n Simple_repeat 4245 9477690 9477861 9477837 MLT1I LTR/MaLR 4250 10760646 10760936 10760670 L2 LINE/L2 4254 18264045 18268543 18264056 L1PA13 LINE/L1 4283 9808749 9808850 9808815 L2 LINE/L2 4289 10717187 10717505 10717322 AluSx SINE/Alu 4299 10854674 10854787 10854714 L2 LINE/L2 4301 14294470 14294514 14294499 MIR SINE/MIR 4304 27670132 27670663 27670158 HAL1 LINE/L1 4318 17300420 17300562 17300498 MIR SINE/MIR 4322 30242097 30242500 30242262 MLT1C LTR/MaLR 4323 27710545 27710655 27710582 L2 LINE/L2 4328 16887514 16887684 16887623 MIR SINE/MIR 4335 33912581 33912811 33912681 AluSx SINE/Alu 4356 19367051 19367227 19367187 MIR SINE/MIR 4374 16828502 16828866 16828729 THE1B LTR/MaLR 4388 31728170 31728695 31728421 MER74A LTR/ERVL 4401 20873988 20874135 20874126 MIR SINE/MIR 4403 18121165 18121562 18121201 MSTA LTR/MaLR 4406 18890253 18890411 18890400 MIR SINE/MIR 4408 29351815 29351982 29351981 AluSg/x SINE/Alu 4409 28275202 28275462 28275244 L1MB3 LINE/L1 4412 18121165 18121562 18121180 MSTA LTR/MaLR 4423 33147722 33148974 33147842 MLT1A1-int LTR/MaLR 4425 33004558 33004743 33004687 MIR SINE/MIR 4429 30094451 30094661 30094492 MLT1A1 LTR/MaLR 4443 31205481 31205689 31205683 L1MDb LINE/L1 4444 11136735 11136932 11136922 MIR SINE/MIR 4446 18036574 18036873 18036661 AluSc SINE/Alu 4454 26842787 26843092 26843053 AluSq SINE/Alu 4457 17652147 17652449 17652272 AluSx SINE/Alu 4464 33179520 33180921 33180671 L1ME3A LINE/L1 4465 25568368 25568659 25568591 AluSp SINE/Alu 4468 18626360 18626485 18626448 AluSg/x SINE/Alu 4481 22953994 22954217 22954138 MER46A DNA/MER2_type 4483 14570144 14570441 14570185 AluSx SINE/Alu 4487 22953156 22953621 22953420 MLT1F LTR/MaLR 4490 18474670 18475587 18475016 L1MC3 LINE/L1 4492 13932745 13933026 13932919 AluSx SINE/Alu 4509 13885026 13885413 13885180 AluSp SINE/Alu 4510 27386656 27386742 27386719 L2 LINE/L2 4512 19377044 19377174 19377102 MLT1H LTR/MaLR 4513 14079978 14080156 14080155 L3 LINE/CR1 5107 97469 97749 97733 AluSc SINE/Alu 5108 97469 97749 97706 AluSc SINE/Alu 5532 250998 251306 251304 AluSx SINE/Alu 5533 251307 252577 251367 L1M2 LINE/L1 5812 122646 123342 122859 L1MB3 LINE/L1 5813 122646 123342 123226 L1MB3 LINE/L1 5814 122646 123342 122912 L1MB3 LINE/L1 5815 122646 123342 123168 L1MB3 LINE/L1 7134 448 886 761 MER4B-int LTR/ERV1 7135 448 886 512 MER4B-int LTR/ERV1 7136 448 886 605 MER4B-int LTR/ERV1 7489 580769 582873 582764 L1MA9 LINE/L1 8383 17648542 17648836 17648611 Charlie8 DNA/MER1_type 8700 18528778 18531699 18530070 L1PA15-16 LINE/L1 8701 18528778 18531699 18530052 L1PA15-16 LINE/L1 9297 24685443 24685729 24685575 AluSx SINE/Alu 9316 18714545 18715158 18714769 L2 LINE/L2 9317 18714545 18715158 18714609 L2 LINE/L2 10245 31574103 31574392 31574203 MLT1J2 LTR/MaLR 10832 16857423 16857775 16857764 THE1A LTR/MaLR 10977 7569943 7570253 7570071 AluSg SINE/Alu 10979 7569943 7570253 7569953 AluSg SINE/Alu 11692 27047904 27047948 27047907 MIR SINE/MIR 11803 21108896 21109061 21108971 MLT1J LTR/MaLR 11829 24529075 24529375 24529321 AluSx SINE/Alu 11841 1717526 1717799 1717530 AluJb SINE/Alu 12032 26599321 26599520 26599418 MIR SINE/MIR 12142 32731199 32731422 32731282 MLT1J2 LTR/MaLR 13027 5164130 5164385 5164285 AluSx SINE/Alu 13661 31062711 31063137 31062905 MLT1C LTR/MaLR 13960 20541528 20541827 20541732 AluJo SINE/Alu 14245 3073311 3073475 3073399 MER3 DNA/MER1_type 14495 28097641 28097828 28097686 L1ME4a LINE/L1 14570 29132253 29132406 29132351 MIR SINE/MIR 14653 27175825 27175924 27175848 MIR SINE/MIR 14668 30993548 30994246 30993820 L1MB8 LINE/L1 15193 23109968 23110268 23110234 AluSg SINE/Alu 15290 8830152 8830457 8830159 AluSc SINE/Alu 15562 20311025 20311339 20311209 AluSx SINE/Alu 15563 20311025 20311339 20311220 AluSx SINE/Alu 15565 20311557 20311850 20311837 AluSg SINE/Alu 15566 20311557 20311850 20311831 AluSg SINE/Alu 15610 17496537 17496725 17496611 MIR SINE/MIR 15611 17496537 17496725 17496648 MIR SINE/MIR 15761 26679928 26680140 26679940 AluJo SINE/Alu 15777 7307836 7308142 7307947 AluJo SINE/Alu 16288 26420779 26421100 26420971 AluSx SINE/Alu 17509 21092753 21093002 21092763 Charlie8 DNA/MER1_type 17968 30219014 30219180 30219047 L2 LINE/L2 18323 27120008 27120190 27120024 MIR SINE/MIR 18385 24974383 24974690 24974548 AluJo SINE/Alu 18440 8825665 8826026 8825742 HsTC2 DNA/Tc2 18441 8825334 8825664 8825584 AluSx SINE/Alu 18442 8824741 8824915 8824899 MER58A DNA/MER1_type 18790 12165355 12165510 12165382 L2 LINE/L2 18916 5281995 5282178 5282117 AluSg/x SINE/Alu 18917 5281995 5282178 5282059 AluSg/x SINE/Alu 19002 9801638 9801763 9801674 MIR3 SINE/MIR 19460 27596213 27597364 27597185 L2 LINE/L2 20446 17607535 17607640 17607604 MIR SINE/MIR 21184 20104188 20104654 20104653 MER41E LTR/ERV1 21203 31028824 31028941 31028846 MER5B DNA/MER1_type 21398 23471897 23472098 23472032 MIR SINE/MIR 21399 23471897 23472098 23471941 MIR SINE/MIR 21400 23962721 23962992 23962987 L2 LINE/L2 21401 23962721 23962992 23962847 L2 LINE/L2 21455 16903214 16903582 16903431 THE1C LTR/MaLR 21507 16638150 16638244 16638150 MIR SINE/MIR 21522 33940820 33940869 33940865 Tigger5 DNA/MER2_type 21610 31102908 31103422 31102918 MLT1H LTR/MaLR 21656 31595723 31595979 31595763 AluSg1 SINE/Alu 21657 31595723 31595979 31595846 AluSg1 SINE/Alu 21658 31595983 31596407 31596081 L1P LINE/L1 21809 22669002 22669419 22669257 MSTC LTR/MaLR 22064 16033157 16033286 16033231 MER102b DNA/MER1_type 22072 9171408 9171718 9171611 AluSx SINE/Alu 22185 28095862 28096577 28096323 L2 LINE/L2 22361 4579479 4579797 4579613 AluJo SINE/Alu 22411 34369397 34369614 34369544 AluSg/x SINE/Alu 22681 278902 279577 279182 HSREP522 Satellite/telo 22728 20068095 20068542 20068115 MLT1D LTR/MaLR 23056 3295630 3295911 3295798 AluSx SINE/Alu 23096 28009944 28010068 28009992 MIR SINE/MIR 23130 30320450 30320753 30320597 AluSg SINE/Alu 23313 21106800 21107402 21106980 HERV16 LTR/ERVL 23533 17475032 17475373 17475358 MER2 DNA/MER2_type 23662 4902909 4903211 4902946 AluSx SINE/Alu 23701 16626913 16627304 16627015 LTR16C LTR/ERVL 23808 31102273 31102349 31102306 L1ME LINE/L1 24062 20915857 20916392 20915918 L2 LINE/L2 24220 11487141 11487273 11487176 FLAM_C SINE/Alu 24283 5463806 5463920 5463864 AluJo SINE/Alu 24551 18916835 18917006 18916922 L2 LINE/L2 24562 18404482 18407189 18405348 MER66-int LTR/ERV1 24563 18404482 18407189 18405582 MER66-int LTR/ERV1 24871 24471403 24471551 24471474 MIR SINE/MIR 24885 33833837 33834145 33834135 AluSx SINE/Alu 24911 15833989 15834293 15834219 AluSx SINE/Alu 25051 27443545 27443869 27443797 AluY SINE/Alu 25218 610955 612022 610982 MER11C LTR/ERVK 25516 17514058 17514591 17514317 L1MB7 LINE/L1 25702 33068341 33068763 33068690 MLT2A1 LTR/ERVL 25758 18866671 18866872 18866845 MIR SINE/MIR 25808 27256675 27256982 27256805 AluSx SINE/Alu 25809 27256675 27256982 27256731 AluSx SINE/Alu 26182 31758054 31758517 31758473 L1MB7 LINE/L1 26183 31758054 31758517 31758516 L1MB7 LINE/L1 26380 28096926 28097065 28096995 L2 LINE/L2 26416 27070597 27070889 27070870 AluSx SINE/Alu 26793 28564473 28564592 28564541 L1MB7 LINE/L1 26820 16311311 16311481 16311381 MIR SINE/MIR 27001 2672366 2672665 2672583 AluSx SINE/Alu 27113 11167813 11168114 11168043 AluSx SINE/Alu 27806 19270259 19270350 19270313 (CCCCG)n Simple_repeat 27807 19270259 19270350 19270292 (CCCCG)n Simple_repeat 28039 3145239 3145563 3145345 Tigger3(Golem) DNA/MER2_type 28122 20051129 20051267 20051204 L2 LINE/L2 28141 20662637 20662810 20662706 MIR SINE/MIR 28172 17160436 17160577 17160467 MIR SINE/MIR 28287 9795549 9795698 9795666 MIR SINE/MIR 28557 1878543 1878821 1878727 AluSx SINE/Alu 28558 1878481 1878542 1878522 MLT1E LTR/MaLR 28682 4839443 4839720 4839508 AluSx SINE/Alu 28692 25220582 25220724 25220699 L2 LINE/L2 28772 6529867 6530173 6530110 Tigger2a DNA/MER2_type 28792 17394742 17395012 17394744 MLT1A1 LTR/MaLR 28793 17394742 17395012 17394850 MLT1A1 LTR/MaLR 28888 30376240 30376421 30376251 L1M3 LINE/L1 28925 11483100 11483536 11483202 MLT1H LTR/MaLR 29270 9540640 9540917 9540784 AluSq SINE/Alu 29358 26251241 26251449 26251316 MLT1C LTR/MaLR 29477 27192747 27192880 27192863 MIR SINE/MIR 29482 282668 282968 282881 AluSx SINE/Alu 29483 282668 282968 282871 AluSx SINE/Alu 29484 282668 282968 282835 AluSx SINE/Alu 29485 282343 282654 282633 AluSx SINE/Alu 29488 29167313 29167670 29167626 MSTB LTR/MaLR 29587 27804986 27805772 27805596 L1MC2 LINE/L1 29640 16342073 16342236 16342145 MIR SINE/MIR 30320 5095532 5096097 5096070 HSATI Satellite 30398 33283669 33283965 33283696 AluSx SINE/Alu 30920 10645677 10645792 10645719 L2 LINE/L2 31080 15965725 15965975 15965727 AluJo SINE/Alu 31156 9471172 9471249 9471217 FRAM SINE/Alu 31221 1708792 1709085 1709040 AluY SINE/Alu 31477 11289657 11289783 11289739 MIR3 SINE/MIR 31577 26494146 26494449 26494416 AluSp SINE/Alu 31578 26494146 26494449 26494194 AluSp SINE/Alu 31729 5422665 5422797 5422744 L1ME4a LINE/L1 31795 15770738 15770871 15770784 MIR SINE/MIR 31861 11370694 11371080 11370899 MLT1B LTR/MaLR 31954 9066105 9066189 9066172 MIR SINE/MIR 32031 11231637 11231741 11231689 MIR SINE/MIR 32032 11231851 11232228 11231894 L2 LINE/L2 32475 11484018 11484119 11484043 MIR3 SINE/MIR 32505 29176740 29177034 29176806 AluSg SINE/Alu 32714 20662920 20663219 20663216 AluSc SINE/Alu 32715 20662920 20663219 20663212 AluSc SINE/Alu 32716 20662920 20663219 20663047 AluSc SINE/Alu 32813 21032842 21033041 21032854 MER44D DNA/MER2_type 32865 18970185 18970267 18970233 CT-rich Low_complexity 32929 32073315 32073449 32073378 AluJo SINE/Alu 32930 32073035 32073311 32073187 AluJb SINE/Alu 32936 27056141 27056600 27056185 MLT1D LTR/MaLR 32953 33874943 33875030 33875014 MER58 DNA/MER1_type 33080 15162086 15162370 15162211 AluJo SINE/Alu 33263 30251570 30251885 30251609 MLT1D LTR/MaLR 33276 25106731 25107028 25106802 AluJo SINE/Alu 33673 1717526 1717799 1717661 AluJb SINE/Alu 33926 10562293 10562594 10562443 AluSp SINE/Alu 33950 10402080 10402317 10402111 MIR SINE/MIR 33951 28372489 28372657 28372601 L2 LINE/L2 34377 28370976 28371032 28370996 GA-rich Low_complexity 34719 20081432 20081481 20081440 (TG)n Simple_repeat 34839 17633994 17635171 17634063 L1MB7 LINE/L1 34840 17633994 17635171 17634118 L1MB7 LINE/L1 34862 17265183 17265792 17265629 L1MB3 LINE/L1 34908 18118993 18119344 18119245 THE1B LTR/MaLR 34984 20080430 20080621 20080590 MIR SINE/MIR 35044 19500240 19500335 19500287 L1MC4 LINE/L1 35179 14420918 14421476 14421209 L1ME1 LINE/L1 35228 8739413 8739584 8739446 MIR SINE/MIR 35441 21143925 21144224 21144212 AluSq SINE/Alu 35448 26078411 26078441 26078411 (CAAAAA)n Simple_repeat 35512 4985132 4985276 4985228 MIR SINE/MIR 35647 27441333 27442132 27441802 L1MDa LINE/L1 35681 27864723 27864913 27864861 MER112 DNA/MER1_type 35685 28635003 28635402 28635287 MER21B LTR/ERV1 35725 2400361 2400674 2400651 AluY SINE/Alu 35825 19365341 19365465 19365415 MIR SINE/MIR 35836 16353291 16353413 16353313 MIR SINE/MIR 35899 4365290 4365450 4365449 FRAM SINE/Alu 36035 2897684 2898322 2897769 L1ME LINE/L1 36083 8932130 8932427 8932137 AluSq SINE/Alu 36110 4884558 4884828 4884716 AluJb SINE/Alu 36112 21961222 21961532 21961493 AluSx SINE/Alu 36175 21717216 21717509 21717314 AluSq SINE/Alu 36278 13821745 13821876 13821778 AluJb SINE/Alu 36455 3355079 3355966 3355879 LTR57-int LTR/ERVL 36456 3355079 3355966 3355909 LTR57-int LTR/ERVL 36457 3355970 3356239 3356178 AluJo SINE/Alu 36496 22268513 22268644 22268516 MIR SINE/MIR 36884 7828383 7828767 7828416 MER84-int LTR/ERV1 37399 25653411 25653538 25653443 L2 LINE/L2 37703 3493549 3493816 3493706 AluJo SINE/Alu 38398 28454243 28454342 28454318 MLT1A2 LTR/MaLR 38460 10275562 10275724 10275595 MER103 DNA 38505 11241898 11242015 11241919 MER117 DNA/MER1_type 38540 27267258 27267983 27267747 HAL1 LINE/L1 38554 10216040 10216523 10216073 L1MA5 LINE/L1 38556 10216548 10218481 10218439 L1MA5 LINE/L1 38557 10216548 10218481 10218357 L1MA5 LINE/L1 39363 10213675 10213734 10213713 MIR SINE/MIR 39913 552559 570902 558824 CER Satellite 39914 552559 570902 558805 CER Satellite 39996 29212875 29213515 29212986 MER4A-int LTR/ERV1 39997 29212875 29213515 29213245 MER4A-int LTR/ERV1 40168 15729254 15729526 15729433 MARNA DNA/Mariner 41604 18389967 18390053 18390036 MIR SINE/MIR 41609 24444891 24444977 24444929 MIR SINE/MIR 41759 19948434 19948668 19948620 MLT1G1 LTR/MaLR 41834 2023862 2023940 2023898 GA-rich Low_complexity 42185 25906802 25907067 25906946 AluY SINE/Alu 42296 6491748 6492029 6491778 AluJb SINE/Alu 42680 17508511 17510099 17508585 MSTB-int LTR/MaLR 42681 17508047 17508508 17508288 MSTB LTR/MaLR 42882 14006547 14007135 14006592 L2 LINE/L2 42961 17059334 17059688 17059460 THE1C LTR/MaLR 42980 16579548 16579691 16579598 MER20 DNA/MER1_type 42994 17718701 17718985 17718869 AluJo SINE/Alu 43189 451273 552529 539473 CER Satellite 43190 451273 552529 539140 CER Satellite 43324 281855 281974 281916 AluSq/x SINE/Alu 43508 13037982 13038318 13038081 L1MC5 LINE/L1 43938 33081607 33082227 33081974 L1MC3 LINE/L1 43939 33081607 33082227 33082166 L1MC3 LINE/L1 43942 33081607 33082227 33081919 L1MC3 LINE/L1 43943 33081607 33082227 33081944 L1MC3 LINE/L1 44314 25672626 25672842 25672676 AluJo SINE/Alu 44352 15718499 15718781 15718525 AluSx SINE/Alu 44713 451273 552529 475270 CER Satellite 46961 451273 552529 463544 CER Satellite 47488 25849802 25851097 25849915 MER52A LTR/ERV1 47644 28707160 28707352 28707252 LTR2B LTR/ERV1 47646 10790953 10791130 10791026 MIR SINE/MIR 47937 451273 552529 506711 CER Satellite 47938 451273 552529 506453 CER Satellite 48348 20967347 20969503 20967440 L1MA3 LINE/L1 48370 9602208 9603577 9603528 L1MC4 LINE/L1 48371 4348404 4348727 4348478 AluSx SINE/Alu 48372 4348404 4348727 4348449 AluSx SINE/Alu 48552 26268267 26268395 26268341 AluJo SINE/Alu 48553 26267808 26268108 26268069 AluJb SINE/Alu 48801 20541122 20541415 20541311 AluJo SINE/Alu 50259 4902909 4903211 4903158 AluSx SINE/Alu 50422 23573188 23573218 23573189 (CA)n Simple_repeat 50519 12648720 12649093 12649034 L1MC4 LINE/L1 50756 32322431 32322635 32322438 L2 LINE/L2 50766 11774137 11774170 11774153 (CA)n Simple_repeat 50767 11774025 11774136 11774063 L2 LINE/L2 50964 23728659 23728808 23728759 MER5A DNA/MER1_type 51402 119725 120499 119941 L1M4 LINE/L1 51423 17696163 17696325 17696216 MIR SINE/MIR 51472 14881560 14881679 14881577 AluJo SINE/Alu 51473 14881393 14881539 14881527 AluJo SINE/Alu 51485 16316736 16316952 16316916 MER20 DNA/MER1_type 51828 29110327 29110359 29110349 U2 snRNA 52908 32249215 32250048 32249524 L1MD3 LINE/L1 52974 3050440 3051958 3051290 L2 LINE/L2 52996 4941323 4941512 4941337 AluJo SINE/Alu 53053 10202370 10202911 10202635 L2 LINE/L2 53350 20931473 20931915 20931900 MLT1C LTR/MaLR 53709 2961358 2961667 2961587 AluJb SINE/Alu 54109 29637583 29637739 29637600 AluSq SINE/Alu 54114 25095209 25095401 25095388 MIR SINE/MIR 54387 14178278 14178382 14178307 Tigger3(Golem) DNA/MER2_type 54481 14132620 14132931 14132655 AluSx SINE/Alu 54488 18548905 18549326 18549074 MSTA LTR/MaLR 55126 21576709 21577528 21577050 MER63C DNA/MER1_type 55212 16686506 16686627 16686566 MER2 DNA/MER2_type 55213 16686628 16686928 16686647 AluSg SINE/Alu 55214 16686628 16686928 16686801 AluSg SINE/Alu 55215 16686628 16686928 16686925 AluSg SINE/Alu 55235 12062020 12062284 12062030 AluJb SINE/Alu 55236 12061763 12062019 12062018 MER33 DNA/MER1_type 55237 12061763 12062019 12061975 MER33 DNA/MER1_type 55973 8680098 8680374 8680124 AluSx SINE/Alu 56348 31801107 31802423 31801730 L1ME2 LINE/L1 56687 3499236 3499523 3499361 AluJo SINE/Alu 56688 3499236 3499523 3499324 AluJo SINE/Alu 56932 6585764 6586087 6585941 L1MEc LINE/L1 56990 12470190 12470489 12470452 AluY SINE/Alu 57336 16622751 16623001 16622957 MIR SINE/MIR 57337 16622609 16622737 16622659 FLAM_A SINE/Alu 57516 17953193 17953339 17953245 MIR SINE/MIR 57886 8712591 8715587 8713076 L1MA2 LINE/L1 58019 10368713 10369213 10368726 MLT1K LTR/MaLR 58254 2150716 2150893 2150721 MER20 DNA/MER1_type 58255 2150716 2150893 2150779 MER20 DNA/MER1_type 58289 22792881 22793043 22792997 AluSg/x SINE/Alu 58290 22792881 22793043 22792881 AluSg/x SINE/Alu 58291 22792648 22792880 22792750 MER1B DNA/MER1_type 58718 6960995 6961351 6961265 MER57A-int LTR/ERV1 58854 26517402 26517697 26517423 AluSx SINE/Alu 58855 26517402 26517697 26517432 AluSx SINE/Alu 59106 28694325 28694720 28694437 MSTA LTR/MaLR 59806 18075339 18075497 18075460 AluSc SINE/Alu 60363 3436864 3437163 3436869 AluY SINE/Alu 60671 18482071 18482447 18482396 L1MC1 LINE/L1 60672 18482448 18482919 18482467 MER66B LTR/ERV1 61099 24447577 24447726 24447664 FRAM SINE/Alu 61248 552559 570902 564702 CER Satellite 61634 4591029 4592955 4592150 L1 LINE/L1 61787 1939831 1940103 1939936 AluSg1 SINE/Alu 61788 1939527 1939820 1939647 AluSp SINE/Alu 62029 30876506 30876793 30876638 L1ME1 LINE/L1 62063 5000921 5001432 5001008 LTR42 LTR/ERVL 62881 451273 552529 543335 CER Satellite 62882 451273 552529 543320 CER Satellite 62883 451273 552529 543279 CER Satellite 62884 451273 552529 543387 CER Satellite 62896 29426499 29426784 29426529 L2 LINE/L2 63227 33324089 33324192 33324169 MLT1J2 LTR/MaLR 63356 13015601 13015782 13015657 MER53 DNA 63611 11595167 11595277 11595214 MLT1D LTR/MaLR 63612 11595072 11595166 11595139 MIR SINE/MIR 63821 29096280 29096579 29096333 AluSx SINE/Alu 63833 18593579 18593630 18593582 L2 LINE/L2 63834 18593579 18593630 18593593 L2 LINE/L2 63933 1908413 1908712 1908525 AluJb SINE/Alu 63934 1908413 1908712 1908634 AluJb SINE/Alu 64414 31643235 31645310 31645279 L1M4 LINE/L1 64462 451273 552529 515204 CER Satellite 64463 451273 552529 515067 CER Satellite 64638 24445015 24445158 24445025 MIR SINE/MIR 64763 15385885 15386189 15385943 AluJb SINE/Alu 64937 10601895 10602114 10601985 MLT1B LTR/MaLR 64938 10601895 10602114 10602032 MLT1B LTR/MaLR 65010 6778798 6779208 6778964 MSTB LTR/MaLR 65213 8822769 8823065 8822925 (TCCA)n Simple_repeat 65264 6893958 6897240 6897119 LTR9-int LTR/ERV1 65329 9883035 9883708 9883222 L1MC4a LINE/L1 65330 9883035 9883708 9883464 L1MC4a LINE/L1 65331 9883035 9883708 9883311 L1MC4a LINE/L1 65332 9883035 9883708 9883294 L1MC4a LINE/L1 65333 9883035 9883708 9883179 L1MC4a LINE/L1 65334 9883035 9883708 9883461 L1MC4a LINE/L1 65669 18035789 18036245 18036124 L1MC3 LINE/L1 65670 18035789 18036245 18036017 L1MC3 LINE/L1 65774 16582466 16582829 16582481 MLT1K LTR/MaLR 65817 20786524 20786840 20786785 AluSx SINE/Alu 65835 30352692 30354066 30352973 L1MC3 LINE/L1 65836 30352692 30354066 30352811 L1MC3 LINE/L1 65837 30352692 30354066 30352704 L1MC3 LINE/L1 65999 8712591 8715587 8713047 L1MA2 LINE/L1 66062 18842490 18843005 18842551 L2 LINE/L2 66063 18842490 18843005 18842805 L2 LINE/L2 66064 18842490 18843005 18842811 L2 LINE/L2 66272 18482448 18482919 18482471 MER66B LTR/ERV1 66393 1374139 1374277 1374202 L3 LINE/CR1 66406 552559 570902 564707 CER Satellite 66407 552559 570902 564522 CER Satellite 66408 552559 570902 564561 CER Satellite 66621 14435974 14436361 14435985 LTR54 LTR/ERV1 66622 14435704 14435973 14435946 AluJb SINE/Alu 66803 18112980 18113807 18113176 L1MEc LINE/L1 66804 18112980 18113807 18113287 L1MEc LINE/L1 67116 25938756 25939624 25939293 HAL1 LINE/L1 67135 11520025 11520335 11520159 MLT1H LTR/MaLR 67211 21350026 21350343 21350331 AluSx SINE/Alu 67212 21350344 21350856 21350626 L1MC1 LINE/L1 67767 18936050 18936208 18936203 MIR SINE/MIR 67789 33953662 33954939 33954131 L1MB3 LINE/L1 67846 33682921 33683148 33682985 L1MEd LINE/L1 68484 21780694 21781001 21780830 AluSx SINE/Alu 68485 21780694 21781001 21780985 AluSx SINE/Alu 68486 21780694 21781001 21780918 AluSx SINE/Alu 68856 16138796 16138843 16138821 (TA)n Simple_repeat 68921 28828798 28829362 28829263 L1MB3 LINE/L1 69346 10235438 10235588 10235484 L2 LINE/L2 69618 2060761 2060898 2060775 L1MB8 LINE/L1 69800 6898423 6898520 6898462 L1MC4a LINE/L1 70007 30156211 30156525 30156523 AluSq SINE/Alu 70116 19697233 19697534 19697451 AluSx SINE/Alu 70233 31747582 31747807 31747600 MLT1D LTR/MaLR 70234 31747582 31747807 31747650 MLT1D LTR/MaLR 70235 31745228 31747580 31747281 L1ME3A LINE/L1 70418 14019132 14019521 14019311 L2 LINE/L2 70549 1199389 1200516 1199763 L1M3f LINE/L1 70572 10659717 10659858 10659820 MLT1I LTR/MaLR 71589 14558683 14558844 14558727 AluJb SINE/Alu 71612 10913617 10914068 10913663 LTR16C LTR/ERVL 71616 30326280 30326569 30326419 L1MEd LINE/L1 71617 30325952 30326266 30326159 AluSp SINE/Alu 71618 30325952 30326266 30326148 AluSp SINE/Alu 71742 11627779 11628071 11627967 AluJb SINE/Alu 73375 27537714 27537975 27537864 L1ME4a LINE/L1 73848 14432786 14433080 14432871 AluSx SINE/Alu 74973 33803920 33804219 33804196 AluSg SINE/Alu 75236 16682520 16683057 16682586 MLT1E LTR/MaLR 76154 7051002 7051342 7051267 AluY SINE/Alu 76155 7051002 7051342 7051097 AluY SINE/Alu 76156 7051002 7051342 7051058 AluY SINE/Alu 76400 7085947 7086050 7085969 L1M3 LINE/L1 76401 7086069 7086276 7086177 MLT1A1 LTR/MaLR 76402 7085631 7085933 7085883 AluJo SINE/Alu 76482 24571910 24572200 24571950 AluY SINE/Alu 76669 33683191 33683828 33683345 L1MEd LINE/L1 76670 33683191 33683828 33683784 L1MEd LINE/L1 76671 3223308 3223609 3223572 AluSx SINE/Alu 77638 1499476 1499766 1499674 AluSx SINE/Alu 77856 451273 552529 545799 CER Satellite 78008 7158855 7158963 7158934 MER21B LTR/ERV1 78009 7159002 7159458 7159145 MER21B LTR/ERV1 78055 26599321 26599520 26599458 MIR SINE/MIR 78080 34382901 34384267 34383623 LTR49-int LTR/ERV1 78089 6330703 6330819 6330818 AluSx SINE/Alu 78095 29176740 29177034 29176834 AluSg SINE/Alu 78105 14073576 14073706 14073602 (TATAA)n Simple_repeat 78109 29155603 29155902 29155647 AluSq SINE/Alu 78139 20162656 20162694 20162661 5S rRNA 78167 19574835 19574905 19574905 L2 LINE/L2 78181 31998355 31998735 31998375 MLT1C LTR/MaLR 78318 28330245 28330670 28330445 Charlie1b DNA/MER1_type 78335 20683782 20683951 20683809 MER5B DNA/MER1_type 78341 16474243 16474274 16474265 (CAAAA)n Simple_repeat 78362 16696207 16696399 16696287 MIR3 SINE/MIR 78388 23293569 23293660 23293572 MIR SINE/MIR 78402 10029111 10029590 10029168 MLT1K LTR/MaLR 78518 24452551 24452755 24452642 MIR SINE/MIR 78546 29263250 29263525 29263389 AluSg SINE/Alu 78549 27442529 27443489 27442632 Looper DNA/T2_type 78559 23098976 23099272 23099179 AluSq SINE/Alu 78637 9025191 9025526 9025458 L1MC3 LINE/L1 78646 13166823 13166941 13166888 MIR SINE/MIR 78647 11096680 11096753 11096708 L1MA7 LINE/L1 78698 20549635 20549977 20549674 L2 LINE/L2 78703 10034339 10034811 10034501 LTR16C LTR/ERVL 78707 13683856 13684230 13684098 THE1C LTR/MaLR 78708 13683856 13684230 13683946 THE1C LTR/MaLR 78744 7471314 7471542 7471332 MER115 DNA/AcHobo 78766 10561604 10561717 10561643 AluSg/x SINE/Alu 78801 28318789 28319093 28319051 AluY SINE/Alu 78810 29371864 29372041 29371975 MIR3 SINE/MIR 78811 29371864 29372041 29372018 MIR3 SINE/MIR 78832 20722749 20723054 20722893 AluY SINE/Alu 78853 11644418 11644859 11644525 MLT1C LTR/MaLR 78854 11644418 11644859 11644788 MLT1C LTR/MaLR 78871 33125513 33125629 33125585 MLT1A1 LTR/MaLR 78874 26962324 26962618 26962599 AluSx SINE/Alu 78878 28224785 28225101 28224892 L2 LINE/L2 78893 1964102 1964388 1964309 AluSg SINE/Alu 79220 7158548 7158809 7158755 MLT1C LTR/MaLR 79236 27442529 27443489 27443142 Looper DNA/T2_type 79705 24903887 24904190 24904190 AluSx SINE/Alu 79709 23301592 23301882 23301866 AluSx SINE/Alu 80270 27876272 27876406 27876307 MIR SINE/MIR 80271 27876272 27876406 27876323 MIR SINE/MIR 80272 27876272 27876406 27876369 MIR SINE/MIR 80698 22753698 22753833 22753805 (CACG)n Simple_repeat 81151 31302806 31303113 31303060 AluSp SINE/Alu 81152 31301477 31301831 31301532 MER31A LTR/ERV1 81153 23458110 23458324 23458151 MIR SINE/MIR 81175 1875408 1875800 1875461 L2 LINE/L2 81176 1875408 1875800 1875617 L2 LINE/L2 81177 1876737 1876861 1876754 LTR10C LTR/ERV1 81369 20030903 20031329 20030946 ERVL LTR/ERVL 81466 19365816 19365840 19365824 (T)n Simple_repeat 81494 3603808 3603901 3603894 C-rich Low_complexity 81507 23110764 23110977 23110886 L1ME3A LINE/L1 81513 2897684 2898322 2897920 L1ME LINE/L1 81578 32551810 32552169 32551847 HAL1 LINE/L1 81602 1481628 1481774 1481758 MER58B DNA/MER1_type 81652 31060694 31060856 31060742 L1MA5 LINE/L1 81658 15068547 15068858 15068561 AluY SINE/Alu 81695 11086742 11086903 11086798 MIR SINE/MIR 81702 27865185 27865216 27865203 (TAAA)n Simple_repeat 81769 1578721 1578969 1578889 AluSp SINE/Alu 81770 1578721 1578969 1578890 AluSp SINE/Alu 81802 32057303 32057615 32057387 L2 LINE/L2 81803 32057303 32057615 32057425 L2 LINE/L2 81825 28825590 28825874 28825857 L2 LINE/L2 81838 27441333 27442132 27441514 L1MDa LINE/L1 81874 24712557 24712610 24712596 tRNA-Lys-AAA tRNA 81914 10563096 10563394 10563254 AluSx SINE/Alu 81982 29139645 29139956 29139761 AluSg SINE/Alu 81988 22578696 22578972 22578964 (TG)n Simple_repeat 81993 20899056 20899152 20899121 MIR SINE/MIR 82012 32989218 32989527 32989304 AluJo SINE/Alu 82065 21961907 21962202 21961908 AluJo SINE/Alu 82066 21961907 21962202 21962134 AluJo SINE/Alu 82073 21718002 21718137 21718130 AluSx SINE/Alu 82098 30786398 30786551 30786520 L1MC4 LINE/L1 82113 6824602 6825689 6825480 L1MC5 LINE/L1 82198 28863035 28863121 28863114 L2 LINE/L2 82199 28863412 28863721 28863508 AluY SINE/Alu 82208 15247688 15247928 15247690 L1MB5 LINE/L1 82261 16816940 16817123 16816980 L2 LINE/L2 82262 16816940 16817123 16817033 L2 LINE/L2 82263 16816940 16817123 16817103 L2 LINE/L2 82288 17792587 17792759 17792617 MER5B DNA/MER1_type 82535 14335754 14336471 14336217 MER4A LTR/ERV1 82536 14335754 14336471 14336074 MER4A LTR/ERV1 82680 20149188 20149501 20149429 AluSx SINE/Alu 82926 29251007 29251203 29251076 AluSc SINE/Alu 83150 9889914 9890185 9890146 L1MD3 LINE/L1 83151 9890406 9890584 9890425 MIR SINE/MIR 83245 29346792 29347067 29346919 AluSg SINE/Alu 83275 27430543 27430672 27430645 L1ME3A LINE/L1 83505 11348912 11349387 11349302 L2 LINE/L2 84034 5599267 5599490 5599298 L1ME4a LINE/L1 84241 30325210 30325488 30325267 AluY SINE/Alu 84242 30325210 30325488 30325326 AluY SINE/Alu 84614 9739762 9739995 9739905 MIR SINE/MIR 85025 29404287 29404586 29404531 AluSp SINE/Alu 85087 31063138 31063620 31063417 MLT1E2 LTR/MaLR 85102 4981963 4982195 4982060 AluJo SINE/Alu 85338 26753786 26753906 26753832 FLAM_C SINE/Alu 85633 33072172 33073846 33072372 L1M4 LINE/L1 85773 27819376 27819519 27819502 Charlie8 DNA/MER1_type 85795 10512224 10512314 10512257 MIR SINE/MIR 85796 10512224 10512314 10512294 MIR SINE/MIR 86126 20551482 20551632 20551578 MIR SINE/MIR 86187 3935857 3935996 3935966 MIR SINE/MIR 86218 15120743 15121006 15120981 AluSx SINE/Alu 86219 15120437 15120740 15120732 AluSp SINE/Alu 86220 15120437 15120740 15120594 AluSp SINE/Alu 86335 13138729 13138876 13138841 MIR SINE/MIR 86346 26121522 26121853 26121813 L2 LINE/L2 86392 17209890 17210055 17209998 MIR SINE/MIR 86424 20486617 20486926 20486745 AluSx SINE/Alu 86451 13473075 13473377 13473356 AluSx SINE/Alu 86523 24264900 24265194 24265013 AluSc SINE/Alu 86567 17230492 17230854 17230682 THE1B LTR/MaLR 86572 18606415 18606483 18606437 L2 LINE/L2 86573 21246618 21246797 21246774 MER3 DNA/MER1_type 86766 7970521 7970676 7970628 AluJo SINE/Alu 86810 22850979 22851070 22851014 AluSx SINE/Alu 86811 22851071 22851214 22851164 MER65C LTR/ERV1 86859 17656301 17656825 17656611 L3 LINE/CR1 86860 17656301 17656825 17656667 L3 LINE/CR1 87297 19979054 19979519 19979478 MLT1D LTR/MaLR 87537 8426228 8427480 8426614 HAL1 LINE/L1 87538 8426228 8427480 8426255 HAL1 LINE/L1 87721 21688202 21688459 21688313 MER46B DNA/MER2_type 87722 21688047 21688155 21688106 FLAM_C SINE/Alu 88015 7434286 7434496 7434479 MIR SINE/MIR 88226 14335754 14336471 14335756 MER4A LTR/ERV1 88295 17755301 17755587 17755413 AluSx SINE/Alu 88296 17752583 17752612 17752608 (A)n Simple_repeat 88327 16490522 16490702 16490636 MER20 DNA/MER1_type 88328 28771610 28771917 28771692 AluSx SINE/Alu 88623 29331092 29331371 29331221 AluSx SINE/Alu 88644 18756548 18756762 18756624 MER58A DNA/MER1_type 89082 22692388 22692677 22692483 AluSg SINE/Alu 89287 27760278 27760446 27760361 MIR3 SINE/MIR 89309 18601749 18602025 18601859 MER69 DNA/AcHobo 89534 23199029 23199108 23199033 L2 LINE/L2 89680 25660585 25660898 25660693 AluJo SINE/Alu 89681 18419809 18420246 18420126 MLT2A2 LTR/ERVL 89682 18419809 18420246 18420080 MLT2A2 LTR/ERVL 89708 30120697 30120802 30120739 FLAM_A SINE/Alu 89709 33833754 33833836 33833762 L1ME3 LINE/L1 89719 21569123 21569268 21569135 MIR SINE/MIR 89773 14298213 14298392 14298273 MIR3 SINE/MIR 90185 7148092 7148239 7148117 MIR3 SINE/MIR 90251 22913553 22913861 22913629 AluSc SINE/Alu 90613 14964670 14964976 14964691 AluSx SINE/Alu 90745 34228920 34229233 34229005 AluSx SINE/Alu 90791 32165325 32165448 32165362 L2 LINE/L2 90859 7940542 7941272 7941043 L2 LINE/L2 91037 26965581 26965734 26965691 MIR SINE/MIR 91223 26161531 26161703 26161696 MIR SINE/MIR 91314 2447892 2448292 2447922 MLT1C LTR/MaLR 92079 23795859 23796331 23795952 L1MC1 LINE/L1 92564 31291572 31291870 31291773 AluY SINE/Alu 92576 16910885 16911095 16911050 LTR16A LTR/ERVL 92577 16911096 16911398 16911181 L1ME2 LINE/L1 92578 16911096 16911398 16911325 L1ME2 LINE/L1 92687 3775502 3775697 3775675 L2 LINE/L2 92815 23972457 23972792 23972633 L1ME3A LINE/L1 92836 16569820 16570252 16570110 (CA)n Simple_repeat 92855 18803278 18803982 18803977 MER21A LTR/ERV1 93129 13134084 13134338 13134184 L2 LINE/L2 93130 13134084 13134338 13134305 L2 LINE/L2 93158 9902074 9902644 9902298 LTR36 LTR/ERV1 93159 9902074 9902644 9902384 LTR36 LTR/ERV1 93390 31347337 31347549 31347524 L1MA8 LINE/L1 93418 1096881 1097174 1097065 AluY SINE/Alu 93574 12521837 12522007 12521868 AluSx SINE/Alu 93575 12522605 12522898 12522720 L1MCc LINE/L1 93613 6166940 6167247 6167138 AluSx SINE/Alu 93614 6166940 6167247 6167035 AluSx SINE/Alu 93732 23138047 23138331 23138099 MER46C DNA/MER2_type 93736 31420885 31421060 31420948 (TCTA)n Simple_repeat 93895 8683337 8683870 8683382 LTR10A LTR/ERV1 93923 27547072 27547373 27547325 AluJo SINE/Alu 93924 27547489 27547669 27547553 L1ME LINE/L1 93925 27547489 27547669 27547568 L1ME LINE/L1 94118 12462191 12462384 12462206 MSTC LTR/MaLR 94157 13061724 13061929 13061832 AluSg/x SINE/Alu 94286 33103397 33104365 33103956 L1M2 LINE/L1 94349 1526167 1526296 1526272 FRAM SINE/Alu 94370 22394631 22395242 22395020 Tigger3b DNA/MER2_type 94439 27810912 27811205 27811159 AluSg SINE/Alu 94675 18855428 18855600 18855554 MIR SINE/MIR 94676 18855787 18856136 18856122 MLT1A1 LTR/MaLR 94685 31524169 31524474 31524466 AluSx SINE/Alu 94686 31524169 31524474 31524420 AluSx SINE/Alu 94814 17154734 17154855 17154836 MIR SINE/MIR 94861 4341251 4341523 4341418 L1ME4a LINE/L1 94862 4341251 4341523 4341454 L1ME4a LINE/L1 95722 27494633 27494828 27494819 MIR SINE/MIR 95723 27494504 27494596 27494581 L2 LINE/L2 95868 28989483 28989852 28989592 MLT1B LTR/MaLR 96140 16348104 16348403 16348110 AluY SINE/Alu 96141 16348104 16348403 16348116 AluY SINE/Alu 96639 18961017 18961391 18961286 MSTA LTR/MaLR 96640 18961017 18961391 18961238 MSTA LTR/MaLR 96688 32775678 32775980 32775734 AluSg SINE/Alu 96689 32775678 32775980 32775751 AluSg SINE/Alu 96703 25234155 25234467 25234254 AluJo SINE/Alu 96745 11475811 11475949 11475850 MIR SINE/MIR 96955 7383286 7383662 7383494 L1MB4 LINE/L1 96977 10720079 10720191 10720087 MIR SINE/MIR 97142 6287315 6288561 6287545 L1PB1 LINE/L1 97193 15887094 15887406 15887301 AluSq SINE/Alu 97434 17123930 17124505 17123953 L1PA13 LINE/L1 97563 33154899 33155433 33155100 MLT1D LTR/MaLR 97631 32514086 32514295 32514263 MIR SINE/MIR 97876 1600566 1600749 1600642 MLT1F LTR/MaLR 97898 17829237 17829532 17829337 AluY SINE/Alu 98116 3180088 3180401 3180089 AluSx SINE/Alu 98265 3544077 3544359 3544193 L1MC4a LINE/L1 98266 23347625 23347927 23347627 L2 LINE/L2 98267 23347625 23347927 23347828 L2 LINE/L2 98268 21170461 21171276 21170598 L1ME3A LINE/L1 98503 11918490 11919130 11918861 L2 LINE/L2 98504 11918490 11919130 11919043 L2 LINE/L2 98505 11919315 11919358 11919355 L2 LINE/L2 98530 26244996 26245140 26245106 MIR SINE/MIR 98918 31895345 31895639 31895352 AluSc SINE/Alu 99042 32125690 32126091 32125963 L1MC2 LINE/L1 99055 12955074 12955356 12955146 AluY SINE/Alu 99441 6755502 6755768 6755738 AluJb SINE/Alu 99470 16467395 16467575 16467431 MIR SINE/MIR 99483 23309743 23310054 23309946 AluSg SINE/Alu 99492 28253410 28254771 28253692 L1ME LINE/L1 99493 28253410 28254771 28253702 L1ME LINE/L1 99584 33230888 33231333 33231120 L1ME3A LINE/L1 99585 33230888 33231333 33231263 L1ME3A LINE/L1 99769 13710435 13710571 13710496 FLAM_C SINE/Alu 99772 15860581 15860876 15860740 AluSx SINE/Alu 99777 9493617 9493677 9493659 (GA)n Simple_repeat 99783 28275202 28275462 28275284 L1MB3 LINE/L1 99784 28275202 28275462 28275283 L1MB3 LINE/L1 99790 15192944 15193220 15193188 AluJo SINE/Alu 99794 16465689 16465738 16465696 (TCCC)n Simple_repeat 99795 17753880 17754031 17753926 MER5B DNA/MER1_type 99805 31445640 31446076 31445830 L1 LINE/L1 99807 7401389 7401566 7401555 HSATI Satellite 99808 13710668 13710954 13710935 AluSg SINE/Alu 99809 13710668 13710954 13710831 AluSg SINE/Alu 99823 33179520 33180921 33180809 L1ME3A LINE/L1 99827 4488970 4489266 4489068 AluY SINE/Alu 99834 20727917 20728467 20727921 L1MC4 LINE/L1 99835 20726754 20727915 20727531 L1PA16 LINE/L1 99838 4488970 4489266 4489067 AluY SINE/Alu 99845 7239125 7239424 7239270 AluSx SINE/Alu 99846 19102763 19103074 19102876 AluY SINE/Alu 99848 6897567 6897685 6897659 LTR9-int LTR/ERV1 99852 24205319 24206180 24206031 L2 LINE/L2 99855 7593581 7593686 7593618 Charlie5 DNA/MER1_type 99856 31862969 31863471 31863165 L1MC5 LINE/L1 99858 20405901 20406203 20406067 AluSx SINE/Alu 99859 20405901 20406203 20406061 AluSx SINE/Alu 99861 25579272 25579556 25579539 AluJo SINE/Alu 99862 2144453 2144752 2144477 AluSx SINE/Alu 99863 2144453 2144752 2144683 AluSx SINE/Alu 99866 6516090 6516388 6516347 AluSx SINE/Alu 99867 14227538 14227728 14227686 MIR SINE/MIR 99868 14227538 14227728 14227658 MIR SINE/MIR 99871 19166956 19167068 19167055 L2 LINE/L2 99872 13103256 13103364 13103277 MER72 LTR/ERV1 99874 27705396 27705585 27705431 L2 LINE/L2 99877 28842502 28842766 28842742 L1MB8 LINE/L1 99878 28842502 28842766 28842534 L1MB8 LINE/L1 99889 18602293 18603086 18603079 MER69 DNA/AcHobo 99908 27362937 27363309 27363190 L1MEc LINE/L1 99917 820613 820737 820635 FLAM_C SINE/Alu 99920 820398 820612 820546 L1M4 LINE/L1 99922 33493097 33493401 33493163 AluSx SINE/Alu 99925 10761781 10762190 10761900 MSTA LTR/MaLR 99926 10761752 10761780 10761768 MIR3 SINE/MIR 99928 6624636 6624903 6624762 Charlie6 DNA/MER1_type 99929 6624636 6624903 6624715 Charlie6 DNA/MER1_type 99930 22650314 22650488 22650459 MIR SINE/MIR 99931 22650527 22650787 22650607 AluY SINE/Alu 99935 18967486 18967710 18967537 MER113 DNA/MER1_type? 99942 16916243 16916571 16916546 L2 LINE/L2 99949 17457559 17457849 17457579 AluSq SINE/Alu 99958 23588928 23589262 23588970 MER1B DNA/MER1_type 99959 19081147 19081443 19081408 AluSx SINE/Alu 99960 17947610 17948026 17947817 MSTA LTR/MaLR 99961 17947610 17948026 17947971 MSTA LTR/MaLR 99965 30217106 30217387 30217355 AluSx SINE/Alu 99966 30217106 30217387 30217372 AluSx SINE/Alu 99969 18408328 18409094 18408390 MER66-int LTR/ERV1 99971 19104080 19104377 19104233 AluJo SINE/Alu 99972 19104080 19104377 19104206 AluJo SINE/Alu 99974 13610769 13611102 13610950 L1MC4a LINE/L1 99975 13610769 13611102 13611024 L1MC4a LINE/L1 99976 15013767 15014062 15013775 AluSq SINE/Alu 99977 27463286 27463391 27463336 MIR3 SINE/MIR 99978 20112900 20113293 20112974 LTR57 LTR/ERVL 99979 20112878 20112899 20112889 (TGG)n Simple_repeat 99980 28050682 28050817 28050773 AluSq/x SINE/Alu 99982 118336 118980 118475 L1M4 LINE/L1 99984 19667008 19667319 19667098 AluSx SINE/Alu 99985 19667008 19667319 19667290 AluSx SINE/Alu 99988 1141442 1141939 1141697 MLT1D LTR/MaLR 99997 10222768 10223059 10222800 L2 LINE/L2 100007 13370164 13370386 13370372 L1MA5 LINE/L1 100010 18082748 18083344 18083226 L2 LINE/L2 100012 27706613 27706833 27706744 MIR SINE/MIR 100013 14741455 14741952 14741823 Tigger1 DNA/MER2_type 100016 10434383 10434623 10434593 L1ME4a LINE/L1 100019 10133932 10134129 10134087 MIR SINE/MIR 100020 32938515 32938731 32938665 MLT1E1 LTR/MaLR 100021 32938515 32938731 32938625 MLT1E1 LTR/MaLR 100024 11260530 11260698 11260675 MER113 DNA/MER1_type? 100027 12000388 12000555 12000443 L1MA9 LINE/L1 100033 6668484 6669000 6668728 Charlie6 DNA/MER1_type 100046 11188749 11188798 11188790 MIR SINE/MIR 100047 31634424 31634938 31634658 MLT2B3 LTR/ERVL 100050 12553466 12553663 12553653 MIR SINE/MIR 100051 31494528 31495601 31495543 L1ME2 LINE/L1 100060 6623249 6623565 6623555 HERVL LTR/ERVL 100062 9492520 9493113 9492620 LTR26 LTR/ERV1 100066 20649605 20649826 20649779 AluY SINE/Alu 100069 21530 21786 21624 AluJo SINE/Alu 100078 5857709 5857776 5857739 MIR SINE/MIR 100080 28194693 28195007 28194929 AluJb SINE/Alu 100097 18803278 18803982 18803666 MER21A LTR/ERV1 100116 10382418 10382516 10382421 L2 LINE/L2 100120 33143242 33143612 33143434 L1MB3 LINE/L1 100297 13497363 13497525 13497405 AluSg/x SINE/Alu 100298 13429259 13429521 13429436 MLT1K LTR/MaLR 100299 13430939 13431235 13431029 AluJo SINE/Alu 100301 13299888 13299972 13299923 FLAM_A SINE/Alu 100304 7043500 7043541 7043541 5S rRNA 100305 7074058 7074221 7074176 MER45A DNA/AcHobo 100306 6972050 6972913 6972261 L1M4 LINE/L1 100312 31361510 31361794 31361725 AluSg SINE/Alu 100321 16065301 16065600 16065355 Tigger3(Golem) DNA/MER2_type 100322 16079637 16080124 16079763 L2 LINE/L2 100341 3547717 3547967 3547926 AluJb SINE/Alu 100349 3502212 3502765 3502573 L1MB7 LINE/L1 100354 3406315 3406743 3406562 L1MB5 LINE/L1 100359 3441401 3441642 3441491 L1ME2 LINE/L1 100360 3337147 3337324 3337148 MIR3 SINE/MIR 100364 3311503 3311804 3311625 AluSx SINE/Alu 100367 3650476 3650668 3650665 L1MEc LINE/L1 100384 3249296 3249603 3249369 AluSq SINE/Alu 100634 6782992 6783452 6783397 MLT1C LTR/MaLR 100635 6768477 6768800 6768596 ERVL LTR/ERVL 100636 6768477 6768800 6768592 ERVL LTR/ERVL 100637 6768067 6768415 6768372 ERVL LTR/ERVL 100641 6866625 6867812 6867017 ERVL LTR/ERVL 100673 15150631 15150929 15150678 AluJb SINE/Alu 100676 15113716 15113968 15113933 MIR3 SINE/MIR 100889 14132620 14132931 14132810 AluSx SINE/Alu 100983 4713041 4713343 4713041 AluJo SINE/Alu 100984 4920330 4920480 4920375 MIR SINE/MIR 100990 4748222 4748334 4748332 MIR3 SINE/MIR 100991 4750880 4751186 4751020 AluSx SINE/Alu 101211 13509954 13510259 13510124 AluSx SINE/Alu 101335 14052746 14053158 14052764 L1MC4 LINE/L1 101339 13952815 13953430 13953304 MER77 LTR/ERV1 101343 13976540 13976696 13976694 L2 LINE/L2 101344 14552344 14552654 14552546 AluY SINE/Alu 101346 14578779 14578889 14578850 AluSq/x SINE/Alu 101347 14578779 14578889 14578874 AluSq/x SINE/Alu 101348 14553545 14553832 14553680 AluJo SINE/Alu 101469 13869838 13869952 13869874 L1MA8 LINE/L1 101472 13890452 13890739 13890686 AluSp SINE/Alu 101476 13898107 13898394 13898218 AluSx SINE/Alu 101477 13898107 13898394 13898257 AluSx SINE/Alu 101679 1893093 1893356 1893325 AluSx SINE/Alu 101680 1958261 1958553 1958417 L1ME3 LINE/L1 101682 1786603 1786710 1786626 L2 LINE/L2 101684 1824540 1824851 1824787 AluJo SINE/Alu 101707 4437150 4437359 4437240 AluSg/x SINE/Alu 102268 14756488 14756816 14756522 AluYb8 SINE/Alu 102271 14810124 14810348 14810192 AluJo SINE/Alu 102739 14545487 14545788 14545501 AluJb SINE/Alu 102884 13792053 13792207 13792203 L1ME4a LINE/L1 102887 13817910 13818200 13818120 AluJo SINE/Alu 102917 14299876 14300150 14299974 AluSg SINE/Alu 102918 14400632 14400813 14400793 MIR SINE/MIR 102919 14401625 14401932 14401792 AluSp SINE/Alu 102923 14352814 14353290 14353098 L1MEc LINE/L1 102924 14364999 14365128 14365015 MIR SINE/MIR 102926 14369374 14369678 14369382 AluSx SINE/Alu 102929 14382601 14382910 14382653 AluSc SINE/Alu 102930 14382911 14382997 14382977 MIR SINE/MIR 103045 13738540 13738638 13738581 MIR3 SINE/MIR 103046 13738540 13738638 13738618 MIR3 SINE/MIR 103394 14259646 14259934 14259679 MER39 LTR/ERV1 103395 14263342 14263753 14263626 L2 LINE/L2 103396 14263342 14263753 14263687 L2 LINE/L2 103397 14263964 14264135 14263991 L2 LINE/L2 103401 14269391 14269755 14269721 LTR16C LTR/ERVL 103414 15618110 15618404 15618353 AluJo SINE/Alu 103416 15055843 15055929 15055894 MER90 LTR/ERV1 103417 15055458 15055751 15055751 AluJo SINE/Alu 103418 15055141 15055421 15055332 AluSx SINE/Alu 103428 14513420 14513532 14513453 MER81 DNA 103430 14516711 14517021 14516761 AluSx SINE/Alu 103431 14516711 14517021 14516858 AluSx SINE/Alu 103432 14546841 14547118 14546947 AluSq SINE/Alu 103433 14547123 14547225 14547214 FRAM SINE/Alu 103885 14916872 14917051 14917050 (TA)n Simple_repeat 103886 14916872 14917051 14917033 (TA)n Simple_repeat 104022 1602068 1602641 1602259 L1MC4 LINE/L1 104023 1608760 1609071 1608998 AluY SINE/Alu 104024 1608760 1609071 1609062 AluY SINE/Alu 104027 1625788 1626040 1625839 AluSx SINE/Alu 104030 1628985 1629142 1629112 MLT1B LTR/MaLR 104031 1629143 1629441 1629269 AluSx SINE/Alu 104032 1629143 1629441 1629276 AluSx SINE/Alu 104267 1653751 1653872 1653832 MIR SINE/MIR 104274 1646072 1646265 1646147 L1PA6 LINE/L1 104275 1645679 1645943 1645943 AluSg SINE/Alu 104276 1645679 1645943 1645767 AluSg SINE/Alu 104277 1645679 1645943 1645708 AluSg SINE/Alu 104403 13475181 13475460 13475239 AluSg1 SINE/Alu 104404 13475474 13475780 13475496 AluJb SINE/Alu 104405 13475474 13475780 13475525 AluJb SINE/Alu 104696 3860632 3861024 3860637 MSTD LTR/MaLR 105872 2052011 2052143 2052014 FLAM_C SINE/Alu 105874 2042536 2042661 2042554 FLAM_C SINE/Alu 106406 3948248 3948540 3948474 AluSx SINE/Alu 106418 1349726 1351066 1349926 L1P LINE/L1 106419 1349487 1349740 1349558 L1M4 LINE/L1 106420 1349332 1349456 1349401 MSTC LTR/MaLR 106708 4579998 4580300 4580100 AluY SINE/Alu 106709 4579998 4580300 4580125 AluY SINE/Alu 106710 4579998 4580300 4580183 AluY SINE/Alu 106728 4572579 4572762 4572649 AluSp SINE/Alu 106729 4572774 4572937 4572875 MER5A DNA/MER1_type 106730 4577548 4577842 4577677 AluY SINE/Alu 106731 4577548 4577842 4577679 AluY SINE/Alu 106732 4577548 4577842 4577760 AluY SINE/Alu 106748 1298071 1298144 1298129 L2 LINE/L2 106753 1226081 1226356 1226168 L1M4 LINE/L1 106756 1215303 1215570 1215391 L1MA8 LINE/L1 106758 1210709 1210995 1210861 AluY SINE/Alu 106759 1210709 1210995 1210852 AluY SINE/Alu 106760 1210709 1210995 1210833 AluY SINE/Alu 107072 4684180 4684492 4684343 AluSx SINE/Alu 107073 4684612 4684901 4684757 AluSx SINE/Alu 107076 4685525 4685816 4685797 AluSx SINE/Alu 107077 4686057 4686362 4686067 AluY SINE/Alu 107096 2476405 2476697 2476593 AluY SINE/Alu 107099 2673108 2673198 2673120 FRAM SINE/Alu 107108 2750132 2751310 2750338 L1PA16 LINE/L1 107113 2783248 2783348 2783302 MER58B DNA/MER1_type 107117 2782992 2783210 2783175 AluJo SINE/Alu 107501 4944235 4944525 4944391 AluY SINE/Alu 107505 1957797 1958095 1957951 AluY SINE/Alu 107506 1957797 1958095 1958016 AluY SINE/Alu 107583 4349555 4349811 4349632 7SLRNA srpRNA 107585 4349263 4349435 4349416 AluJb SINE/Alu 107586 4349263 4349435 4349414 AluJb SINE/Alu 107593 4374605 4374900 4374649 AluSc SINE/Alu 107594 4374145 4374362 4374267 L1ME LINE/L1 107857 2613000 2613305 2613271 AluJo SINE/Alu 107929 2500490 2500798 2500599 AluY SINE/Alu 108229 6390593 6391264 6391248 HUERS-P3 LTR/ERV1 108294 5541521 5541938 5541849 MLT1H LTR/MaLR 108295 5544593 5544641 5544638 AluSq SINE/Alu 108505 2145469 2145829 2145718 L1M4 LINE/L1 108506 2144753 2144886 2144835 AluY SINE/Alu 108507 2117319 2117444 2117444 FLAM_A SINE/Alu 108517 25842860 25843189 25843123 AluY SINE/Alu 108522 1670518 1670812 1670526 AluSg SINE/Alu 108524 14132620 14132931 14132671 AluSx SINE/Alu 108525 14132971 14133075 14133031 L2 LINE/L2 108693 3564544 3564861 3564822 AluJb SINE/Alu 109789 25235581 25235866 25235585 AluJb SINE/Alu 109790 25235874 25236178 25235982 AluSp SINE/Alu 109791 25236387 25236413 25236397 (A)n Simple_repeat 109793 25256404 25256685 25256410 AluSx SINE/Alu 109794 25270796 25270990 25270841 AluSg/x SINE/Alu 109795 25270991 25271259 25271096 AluSg SINE/Alu 109800 25305739 25305894 25305820 MER5A DNA/MER1_type 109805 22617611 22617993 22617803 MSTA LTR/MaLR 109806 22632742 22633335 22632914 MER77 LTR/ERV1 109810 22651522 22651727 22651606 MIR SINE/MIR 109812 22679392 22679501 22679417 L1M4 LINE/L1 109814 22598243 22599349 22599241 L2 LINE/L2 109815 22598243 22599349 22599259 L2 LINE/L2 109840 17188706 17188805 17188791 MIR SINE/MIR 109861 19165462 19165580 19165474 (TA)n Simple_repeat 109862 19168455 19168955 19168897 MER1A DNA/MER1_type 109864 19171030 19171321 19171161 AluSg SINE/Alu 109868 19186042 19186334 19186184 AluSp SINE/Alu 109869 19186335 19186515 19186441 MER58C DNA/MER1_type 109872 33245902 33246029 33245926 L2 LINE/L2 109877 20680084 20680164 20680140 L2 LINE/L2 109878 20680366 20680516 20680472 L2 LINE/L2 109884 20731966 20732291 20732086 AluSq SINE/Alu 109885 20731966 20732291 20732142 AluSq SINE/Alu 109888 11082827 11083387 11083259 MER119 DNA/MER1_type 109894 10993935 10994141 10994041 MIR3 SINE/MIR 109900 11004176 11004304 11004213 MIR SINE/MIR 109901 11004176 11004304 11004300 MIR SINE/MIR 109902 11005393 11005920 11005764 L2 LINE/L2 109903 11005393 11005920 11005870 L2 LINE/L2 109904 11005937 11006182 11006121 MIR SINE/MIR 109905 11005937 11006182 11006174 MIR SINE/MIR 109908 11006728 11007034 11006854 AluSx SINE/Alu 109910 11007271 11007401 11007323 MIR SINE/MIR 109911 10985286 10985812 10985461 (TCCA)n Simple_repeat 109912 11015512 11015701 11015671 MIR3 SINE/MIR 109914 11018357 11018550 11018412 MIR SINE/MIR 109916 11046998 11047055 11047000 MIR SINE/MIR 109924 11064947 11065081 11064948 MIR SINE/MIR 109931 17471271 17471429 17471398 MIR SINE/MIR 109938 17295307 17295480 17295435 L1ME3A LINE/L1 109939 17295481 17295782 17295517 AluSp SINE/Alu 109943 17333802 17333850 17333830 L2 LINE/L2 109947 17341163 17341459 17341354 AluY SINE/Alu 109948 23410572 23410799 23410576 MIR SINE/MIR 109949 23412213 23412511 23412362 AluSq SINE/Alu 109957 29151184 29151697 29151250 MER21B LTR/ERV1 109958 29163277 29163559 29163521 AluSq SINE/Alu 109960 29163851 29164321 29163911 L2 LINE/L2 109964 29167313 29167670 29167482 MSTB LTR/MaLR 109971 29047050 29047248 29047218 L1ME3A LINE/L1 109975 29061306 29061789 29061369 L1MC4a LINE/L1 109978 15860946 15860999 15860971 MIR SINE/MIR 109979 15890087 15890389 15890290 AluSg SINE/Alu 109982 32097945 32098051 32098028 (CA)n Simple_repeat 109989 32147820 32148100 32147983 AluSg SINE/Alu 109991 31978442 31978486 31978444 MLT1A2 LTR/MaLR 109992 31983762 31984098 31984004 L2 LINE/L2 109995 31989447 31989846 31989492 L1MB7 LINE/L1 109998 31998355 31998735 31998494 MLT1C LTR/MaLR 109999 31998355 31998735 31998528 MLT1C LTR/MaLR 110000 31998736 31999251 31998806 MER63 DNA/MER1_type 110003 32022884 32023145 32023015 MER21B LTR/ERV1 110004 32023198 32023613 32023395 MER21B LTR/ERV1 110011 9514334 9514405 9514356 MER112 DNA/MER1_type 110012 9514334 9514405 9514396 MER112 DNA/MER1_type 110015 9443797 9443991 9443871 MIR SINE/MIR 110022 9479326 9479493 9479430 CT-rich Low_complexity 110023 9479326 9479493 9479475 CT-rich Low_complexity 110024 9481577 9481680 9481639 MIR3 SINE/MIR 110026 9410135 9410297 9410210 L1M1 LINE/L1 110032 9484705 9485023 9484802 AluY SINE/Alu 110037 9499250 9499725 9499302 L1MC5 LINE/L1 110038 12268112 12274294 12273980 L1PA4 LINE/L1 110042 12294966 12296382 12294983 Tigger1 DNA/MER2_type 110044 12262733 12263066 12263001 AluSx SINE/Alu 110045 12262733 12263066 12263062 AluSx SINE/Alu 110051 16088032 16088326 16088272 L1MC2 LINE/L1 110054 16092399 16092479 16092419 AluS SINE/Alu 110058 16108805 16109999 16109457 L1MC5 LINE/L1 110059 16108805 16109999 16109557 L1MC5 LINE/L1 110060 16108805 16109999 16109558 L1MC5 LINE/L1 110061 16128682 16128898 16128841 L2 LINE/L2 110101 19331784 19331896 19331834 MIR3 SINE/MIR 110140 18290291 18290708 18290585 L2 LINE/L2 110143 22080680 22080977 22080702 AluSx SINE/Alu 110144 22080680 22080977 22080709 AluSx SINE/Alu 110145 22080680 22080977 22080763 AluSx SINE/Alu 110148 22093482 22093638 22093536 AluJo SINE/Alu 110149 22046223 22046428 22046271 MIR SINE/MIR 110151 22101249 22101549 22101318 AluJb SINE/Alu 110155 11230058 11230161 11230063 MER91A DNA/MER1_type 110156 11230660 11230828 11230663 L2 LINE/L2 110157 11230660 11230828 11230665 L2 LINE/L2 110158 11230660 11230828 11230758 L2 LINE/L2 110159 11230660 11230828 11230808 L2 LINE/L2 110161 11231637 11231741 11231709 MIR SINE/MIR 110162 11239404 11239583 11239578 MIR SINE/MIR 110206 11167527 11167688 11167645 MER5A DNA/MER1_type 110207 11167813 11168114 11167870 AluSx SINE/Alu 110209 11141007 11141104 11141013 MIR SINE/MIR 110210 11175345 11175395 11175350 L2 LINE/L2 110211 11141597 11141953 11141605 LTR33 LTR/ERVL 110263 29321937 29322290 29322026 MER83B LTR/ERV1 110264 29321937 29322290 29322059 MER83B LTR/ERV1 110267 29331425 29331790 29331639 MLT1B LTR/MaLR 110273 29271483 29271785 29271487 AluSc SINE/Alu 110274 29271483 29271785 29271620 AluSc SINE/Alu 110275 29271483 29271785 29271714 AluSc SINE/Alu 110276 29289353 29289427 29289422 L3 LINE/CR1 110282 30341955 30342263 30341985 AluSx SINE/Alu 110283 30341955 30342263 30341960 AluSx SINE/Alu 110287 30334597 30334977 30334849 MSTB1 LTR/MaLR 110288 30334597 30334977 30334842 MSTB1 LTR/MaLR 110289 30321803 30322234 30322024 MLT1H LTR/MaLR 110290 30321803 30322234 30321995 MLT1H LTR/MaLR 110291 30320450 30320753 30320589 AluSg SINE/Alu 110294 30318676 30319110 30319026 L2 LINE/L2 110299 12997916 12998125 12998005 MIR SINE/MIR 110300 12998126 12998428 12998273 AluSq SINE/Alu 110302 13023240 13024408 13023981 L2 LINE/L2 110321 25603238 25603390 25603344 MLT1K LTR/MaLR 110322 25603417 25603689 25603437 MLT1K LTR/MaLR 110344 22458820 22458869 22458845 (TG)n Simple_repeat 110345 22453030 22453140 22453136 Charlie7 DNA/MER1_type 110346 22577393 22577522 22577463 L2 LINE/L2 110348 22583618 22583891 22583880 AluSp SINE/Alu 110350 18531722 18532004 18531983 L1PA15-16 LINE/L1 110351 18531722 18532004 18531995 L1PA15-16 LINE/L1 110354 18552731 18553071 18552885 MER1B DNA/MER1_type 110355 18553422 18553590 18553517 MLT1K LTR/MaLR 110360 18461613 18461919 18461628 L1P4 LINE/L1 110369 25979463 25979761 25979731 AluY SINE/Alu 110399 16313353 16313693 16313657 MER1B DNA/MER1_type 110400 16321942 16321990 16321947 (TG)n Simple_repeat 110407 16364596 16364968 16364765 L2 LINE/L2 110408 16376188 16376667 16376641 L2 LINE/L2 110411 16255843 16256136 16256097 AluSx SINE/Alu 110434 22025921 22026238 22026049 AluY SINE/Alu 110522 26902196 26902489 26902199 AluSp SINE/Alu 110523 26910391 26910691 26910588 AluSx SINE/Alu 110524 26910693 26910979 26910701 AluSg SINE/Alu 110525 26910693 26910979 26910921 AluSg SINE/Alu 110526 26913177 26913468 26913357 AluSp SINE/Alu 110528 26926618 26926805 26926674 AluSx SINE/Alu 110529 26926618 26926805 26926755 AluSx SINE/Alu 110534 24220459 24221025 24220937 L2 LINE/L2 110537 24247453 24247770 24247729 AluSx SINE/Alu 110538 24116111 24116408 24116230 AluSp SINE/Alu 110539 24162491 24162799 24162607 AluSx SINE/Alu 110542 24201369 24201663 24201519 AluY SINE/Alu 110553 20243808 20243978 20243825 L2 LINE/L2 110554 20244016 20244082 20244036 AluS SINE/Alu 110555 20244083 20244260 20244120 AluY SINE/Alu 110556 20244083 20244260 20244208 AluY SINE/Alu 110557 20250473 20250529 20250515 MIR SINE/MIR 110559 20257777 20257864 20257855 HY4 scRNA 110561 20259019 20259110 20259072 AluSp SINE/Alu 110562 20259114 20259413 20259323 AluSx SINE/Alu 110563 20259616 20259796 20259641 MIR SINE/MIR 110567 21714241 21714504 21714487 AluSq SINE/Alu 110568 21716104 21716403 21716138 AluSg SINE/Alu 110569 21716104 21716403 21716384 AluSg SINE/Alu 110575 23276332 23276622 23276441 AluJo SINE/Alu 110576 23276332 23276622 23276594 AluJo SINE/Alu 110577 23320726 23320876 23320811 MIR SINE/MIR 110579 23328340 23328597 23328527 L1ME4a LINE/L1 110597 20315609 20315726 20315663 AluSg/x SINE/Alu 110598 20316248 20316553 20316384 AluJb SINE/Alu 110599 20316248 20316553 20316489 AluJb SINE/Alu 110601 20328802 20329102 20328969 AluY SINE/Alu 110603 20341728 20341874 20341753 MER5A DNA/MER1_type 110604 20341728 20341874 20341841 MER5A DNA/MER1_type 110605 20341993 20342120 20342073 MER117 DNA/MER1_type 110608 20358379 20358678 20358410 AluSx SINE/Alu 110609 20358379 20358678 20358526 AluSx SINE/Alu 110612 20907596 20907737 20907733 MIR SINE/MIR 110616 20871483 20871633 20871627 MIR SINE/MIR 110617 20946043 20946109 20946075 L2 LINE/L2 110618 20946161 20946280 20946187 MIR3 SINE/MIR 110629 21317584 21317687 21317616 MIR SINE/MIR 110630 21317584 21317687 21317676 MIR SINE/MIR 110645 26234109 26234413 26234411 AluSx SINE/Alu 110650 28388539 28388700 28388686 AluSc SINE/Alu 110651 22711082 22711283 22711100 L1M4 LINE/L1 110653 22805489 22805647 22805619 CT-rich Low_complexity 110661 22832740 22833044 22832847 AluSx SINE/Alu 110664 22737635 22737921 22737671 AluSq SINE/Alu 110668 22710773 22711081 22711004 AluSx SINE/Alu 110669 23562594 23563789 23562665 HAL1 LINE/L1 110670 23575597 23579173 23575742 L1ME LINE/L1 110671 23475248 23475559 23475294 Charlie4a DNA/MER1_type 110674 21919632 21919940 21919852 AluY SINE/Alu 110676 21954426 21954737 21954528 AluSx SINE/Alu 110677 21954426 21954737 21954599 AluSx SINE/Alu 110678 21957643 21957786 21957728 AluJo SINE/Alu 110679 21957787 21958081 21957979 AluY SINE/Alu 110681 21960464 21960511 21960471 MIR SINE/MIR 110682 21978054 21978394 21978193 MLT1A2 LTR/MaLR 110692 9046385 9047201 9046388 L2 LINE/L2 110693 9047539 9047719 9047584 FRAM SINE/Alu 110697 9066544 9066813 9066776 AluSg SINE/Alu 110698 9077979 9078120 9078024 GA-rich Low_complexity 110704 8979264 8979573 8979376 AluSx SINE/Alu 110705 9008665 9008738 9008668 Charlie8 DNA/MER1_type 110706 9008769 9009044 9008857 AluJb SINE/Alu 110707 8945010 8945111 8945019 MIR SINE/MIR 110708 9019360 9019448 9019391 MIR SINE/MIR 110710 9019643 9019706 9019688 MIR SINE/MIR 110711 9019718 9020016 9019781 AluSx SINE/Alu 110728 23128187 23128466 23128415 AluY SINE/Alu 110731 23132831 23133124 23132892 AluSp SINE/Alu 110735 23169655 23169731 23169720 MER69 DNA/AcHobo 110736 23169732 23170032 23169778 AluSx SINE/Alu 110737 23169732 23170032 23169938 AluSx SINE/Alu 110738 23173847 23174148 23173857 AluSx SINE/Alu 110739 23173847 23174148 23173869 AluSx SINE/Alu 110740 23173847 23174148 23174132 AluSx SINE/Alu 110741 23175912 23176210 23176056 L2 LINE/L2 110743 33820272 33820650 33820426 L1ME3 LINE/L1 110747 33830277 33830322 33830288 MIR SINE/MIR 110750 33863626 33863920 33863772 AluSx SINE/Alu 110753 34011586 34011863 34011685 AluSq SINE/Alu 110754 34011864 34012025 34011918 AluSg/x SINE/Alu 110771 33899868 33900165 33900081 AluSp SINE/Alu 110777 33945900 33946211 33946133 AluY SINE/Alu 110789 9630110 9630325 9630310 AluJb SINE/Alu 110793 9708238 9708502 9708361 AluY SINE/Alu 110794 9549364 9549681 9549390 L1M4 LINE/L1 110795 9552236 9552318 9552271 MLT1J2 LTR/MaLR 110796 9586483 9586786 9586625 AluJo SINE/Alu 110801 11607090 11607385 11607360 AluJb SINE/Alu 110802 11607390 11607543 11607501 L1MB4 LINE/L1 110804 11610185 11610485 11610232 AluJb SINE/Alu 110809 11663743 11664041 11664013 MER45B DNA/AcHobo 110812 11669148 11669378 11669261 AluSx SINE/Alu 110814 11601144 11601320 11601264 (TG)n Simple_repeat 110817 9234382 9234927 9234510 L1MB3 LINE/L1 110819 9243182 9243487 9243245 AluY SINE/Alu 110820 9243182 9243487 9243251 AluY SINE/Alu 110821 9247439 9247747 9247447 AluSx SINE/Alu 110822 9247439 9247747 9247509 AluSx SINE/Alu 110823 9247439 9247747 9247527 AluSx SINE/Alu 110824 28398912 28400091 28399456 L1ME2 LINE/L1 110826 28410938 28411275 28410945 MLT1H LTR/MaLR 110834 28432320 28432457 28432377 L2 LINE/L2 110836 28459724 28460029 28459883 AluSp SINE/Alu 110837 28459724 28460029 28459927 AluSp SINE/Alu 110838 28459724 28460029 28459992 AluSp SINE/Alu 110842 28464376 28464509 28464486 MER45A DNA/AcHobo 110843 28465726 28466037 28465877 AluSp SINE/Alu 110849 19376160 19376461 19376183 AluSx SINE/Alu 110850 19376160 19376461 19376451 AluSx SINE/Alu 110851 19376742 19377043 19376837 AluJo SINE/Alu 110856 19421441 19421510 19421497 MIR3 SINE/MIR 110859 19432368 19432885 19432883 MLT1F LTR/MaLR 110864 14715108 14715405 14715352 AluSx SINE/Alu 110868 10152304 10152463 10152332 MIR3 SINE/MIR 110869 10168900 10169213 10169130 AluY SINE/Alu 110872 10112097 10112468 10112122 MLT1A1 LTR/MaLR 110873 28096619 28096889 28096817 L2 LINE/L2 110925 26884823 26885129 26885068 AluSx SINE/Alu 110928 26724268 26724576 26724397 AluSg SINE/Alu 110929 26724268 26724576 26724540 AluSg SINE/Alu 110931 26728037 26728195 26728089 L2 LINE/L2 110932 26728196 26728501 26728296 AluY SINE/Alu 110933 26728196 26728501 26728327 AluY SINE/Alu 110934 26737180 26737231 26737188 L2 LINE/L2 110941 26748959 26749097 26749048 MLT1I LTR/MaLR 110942 26748959 26749097 26749049 MLT1I LTR/MaLR 110947 26775889 26777280 26775989 SVA Other 110948 26775889 26777280 26776085 SVA Other 110949 26775889 26777280 26777039 SVA Other 110951 26779551 26779631 26779560 GA-rich Low_complexity 111018 12185556 12185739 12185696 MER58A DNA/MER1_type 111019 12154523 12155090 12154557 MLT1E LTR/MaLR 111032 10336339 10336638 10336534 AluY SINE/Alu 111033 10336339 10336638 10336587 AluY SINE/Alu 111039 10344288 10344315 10344288 L2 LINE/L2 111040 10252611 10252725 10252674 MER20 DNA/MER1_type 111048 10329481 10329680 10329651 L2 LINE/L2 111049 10329481 10329680 10329671 L2 LINE/L2 111051 25337906 25337944 25337926 (A)n Simple_repeat 111055 30693943 30694234 30694080 AluSp SINE/Alu 111133 27549809 27550132 27549881 AluJo SINE/Alu 111134 27556739 27557169 27557105 L2 LINE/L2 111141 33509864 33510163 33509912 AluY SINE/Alu 111142 33509864 33510163 33509928 AluY SINE/Alu 111143 33509864 33510163 33510089 AluY SINE/Alu 111144 33475710 33475955 33475953 MIR SINE/MIR 111201 18699437 18700269 18699448 LTR1 LTR/ERV1 111202 18699437 18700269 18699582 LTR1 LTR/ERV1 111203 18684490 18684627 18684577 L2 LINE/L2 111204 18684490 18684627 18684626 L2 LINE/L2 111208 18744037 18744434 18744212 L1MD3 LINE/L1 111209 18744437 18744532 18744480 AluY SINE/Alu 111211 18763739 18763897 18763779 L3 LINE/CR1 111212 18764003 18764247 18764011 MIR SINE/MIR 111213 18764003 18764247 18764095 MIR SINE/MIR 111214 18767749 18768059 18767918 AluSx SINE/Alu 111215 18767749 18768059 18767982 AluSx SINE/Alu 111217 18687083 18693211 18693061 L1PA5 LINE/L1 111218 18687083 18693211 18693171 L1PA5 LINE/L1 111220 18776348 18776385 18776380 (GA)n Simple_repeat 111342 13180156 13180837 13180270 L2 LINE/L2 111343 13187563 13187853 13187800 AluSp SINE/Alu 111357 15559840 15560017 15559885 MIR3 SINE/MIR 111358 15539905 15540215 15539914 AluSx SINE/Alu 111359 15570996 15571285 15571217 AluSp SINE/Alu 111449 19105312 19105547 19105404 MIR SINE/MIR 111491 20075118 20075405 20075145 MER77 LTR/ERV1 111513 21868099 21868252 21868133 L2 LINE/L2 111515 21868469 21868719 21868504 AluSx SINE/Alu 111519 21877934 21878228 21878169 AluSx SINE/Alu 111520 21877934 21878228 21878196 AluSx SINE/Alu 111521 21879486 21879998 21879548 HAL1 LINE/L1 111528 21807543 21807721 21807654 MIR3 SINE/MIR 111529 21810582 21810869 21810785 AluY SINE/Alu 111531 21825785 21826347 21826284 L2 LINE/L2 111532 21854162 21854437 21854244 AluJo SINE/Alu 111533 30094451 30094661 30094659 MLT1A1 LTR/MaLR 111536 30176832 30177132 30177040 AluSq SINE/Alu 111537 30176832 30177132 30176945 AluSq SINE/Alu 111541 30193159 30193454 30193367 AluSx SINE/Alu 111543 30110827 30110987 30110985 L1ME LINE/L1 111544 24026483 24026575 24026547 MIR SINE/MIR 111546 23948936 23949241 23949086 AluSx SINE/Alu 111547 23962432 23962720 23962697 AluSc SINE/Alu 111548 23962432 23962720 23962704 AluSc SINE/Alu 111551 23080191 23080562 23080353 MSTC LTR/MaLR 111553 23081053 23081136 23081057 MIR SINE/MIR 111556 11834182 11834490 11834190 AluSx SINE/Alu 111560 11843706 11843876 11843782 L1MD1 LINE/L1 111561 11844208 11844510 11844343 AluSc SINE/Alu 111562 11888885 11889095 11888885 L1MC/D LINE/L1 111563 11708886 11709034 11708963 MIR SINE/MIR 111566 24301664 24301956 24301770 AluSc SINE/Alu 111567 27966213 27966392 27966300 (CA)n Simple_repeat 111568 27966213 27966392 27966363 (CA)n Simple_repeat 111575 27996659 27997021 27996732 THE1B LTR/MaLR 111580 27972073 27972340 27972141 AluSc SINE/Alu 111581 28043623 28043730 28043628 L2 LINE/L2 111582 28043623 28043730 28043642 L2 LINE/L2 111585 28051596 28051870 28051596 AluSp SINE/Alu 111586 28051596 28051870 28051844 AluSp SINE/Alu 111590 30251570 30251885 30251823 MLT1D LTR/MaLR 111591 30251570 30251885 30251810 MLT1D LTR/MaLR 111592 30251570 30251885 30251698 MLT1D LTR/MaLR 111596 30236227 30236578 30236464 MLT1A2 LTR/MaLR 111601 30208229 30208525 30208400 AluSx SINE/Alu 111602 30208229 30208525 30208296 AluSx SINE/Alu 111872 27368187 27368500 27368440 AluSx SINE/Alu 111874 23023167 23023393 23023384 AluJb SINE/Alu 111876 23025616 23025922 23025665 AluSx SINE/Alu 111877 23025616 23025922 23025772 AluSx SINE/Alu 111878 22931104 22931736 22931727 LTR6A LTR/ERV1 111879 22931808 22932205 22931861 LTR49 LTR/ERV1 111888 23005461 23005762 23005624 AluSx SINE/Alu 111889 23005461 23005762 23005731 AluSx SINE/Alu 112055 27914155 27914432 27914335 MER74B LTR/ERVL 112056 27914155 27914432 27914336 MER74B LTR/ERVL 112389 27778408 27778707 27778449 AluSc SINE/Alu 112390 27794209 27794398 27794387 MIR SINE/MIR 112391 27794209 27794398 27794388 MIR SINE/MIR 112395 27767008 27767319 27767020 AluSp SINE/Alu 112557 22430166 22430309 22430284 L1MCa LINE/L1 112558 22430166 22430309 22430285 L1MCa LINE/L1 112629 24987524 24987832 24987734 AluY SINE/Alu 112630 25129994 25130281 25130101 AluY SINE/Alu 112754 11355810 11355873 11355851 MIR SINE/MIR 112755 11355810 11355873 11355870 MIR SINE/MIR 112756 11355810 11355873 11355871 MIR SINE/MIR 112758 11369403 11369529 11369523 GA-rich Low_complexity 112760 11369922 11370291 11370037 MLT1G1 LTR/MaLR 112761 11369922 11370291 11370282 MLT1G1 LTR/MaLR 112762 11370299 11370585 11370338 AluJb SINE/Alu 112764 11385019 11385226 11385101 MIR SINE/MIR 112806 31331588 31331872 31331633 AluY SINE/Alu 112927 27288403 27288523 27288433 L1MEd LINE/L1 112976 19532762 19532907 19532887 AluJo SINE/Alu 112983 20491239 20491541 20491385 AluSx SINE/Alu 112988 20540113 20540416 20540228 AluSg SINE/Alu 112989 20540651 20540711 20540667 MIR SINE/MIR 112992 20544969 20545338 20545015 (TG)n Simple_repeat 112993 20544969 20545338 20545165 (TG)n Simple_repeat 112994 20544969 20545338 20545190 (TG)n Simple_repeat 112995 20548412 20549434 20549122 L2 LINE/L2 112999 18374993 18375287 18375188 AluSx SINE/Alu 113002 26607064 26607367 26607064 AluY SINE/Alu 113003 26521186 26521331 26521244 MIR SINE/MIR 113005 26536011 26536307 26536200 AluJb SINE/Alu 113006 26536011 26536307 26536234 AluJb SINE/Alu 113007 26536581 26536874 26536603 AluJo SINE/Alu 113008 26536581 26536874 26536801 AluJo SINE/Alu 113009 26551917 26552200 26552002 AluSg SINE/Alu 113018 26679628 26679924 26679847 AluY SINE/Alu 113023 8811541 8811677 8811588 L2 LINE/L2 113024 8817817 8818131 8817971 AluY SINE/Alu 113026 28950757 28951217 28951130 MLT1H LTR/MaLR 113027 28954419 28954709 28954519 L1MB3 LINE/L1 113031 28961829 28962139 28962119 AluSq SINE/Alu 113032 28858135 28858449 28858157 AluSx SINE/Alu 113036 28869923 28870008 28869954 MLT1D LTR/MaLR 113037 28872157 28872288 28872242 AluJo SINE/Alu 113045 28880487 28880712 28880579 AluSq SINE/Alu 113046 28880487 28880712 28880649 AluSq SINE/Alu 113051 28891515 28891948 28891559 MER4C LTR/ERV1 113052 28891515 28891948 28891737 MER4C LTR/ERV1 113053 28891515 28891948 28891900 MER4C LTR/ERV1 113057 28927918 28928222 28927992 AluJo SINE/Alu 113058 28927918 28928222 28928213 AluJo SINE/Alu 113059 28935192 28935542 28935235 L1MB3 LINE/L1 113060 28943014 28943114 28943082 (CA)n Simple_repeat 113202 29880809 29881117 29880982 AluY SINE/Alu 113340 11396543 11396718 11396643 (CA)n Simple_repeat 113341 11396543 11396718 11396565 (CA)n Simple_repeat 113344 11498326 11498642 11498329 AluJo SINE/Alu 113346 11480022 11480445 11480238 L1MC4a LINE/L1 113347 11476097 11476529 11476459 LTR16C LTR/ERVL 113352 11465689 11465789 11465771 MIR3 SINE/MIR 113353 11465394 11465646 11465570 MIR SINE/MIR 113354 11465394 11465646 11465567 MIR SINE/MIR 113355 11464690 11464986 11464926 L1PA5 LINE/L1 113356 11442964 11443080 11443061 AluY SINE/Alu 113357 11441781 11441913 11441809 MIR3 SINE/MIR 113359 11425925 11426310 11426010 LTR16C LTR/ERVL 113361 11423363 11423657 11423519 AluSc SINE/Alu 113362 11417732 11418216 11417906 MLT1D LTR/MaLR 113374 10359161 10359471 10359344 AluSq SINE/Alu 113375 10367501 10367812 10367509 AluSx SINE/Alu 113376 10367501 10367812 10367584 AluSx SINE/Alu 113379 10352169 10352321 10352284 MLT1-int LTR/MaLR 113479 30018207 30018506 30018211 AluY SINE/Alu 113480 32702466 32702752 32702568 AluSg SINE/Alu 113481 32702466 32702752 32702614 AluSg SINE/Alu 113486 32728221 32728733 32728708 MER75 DNA/T2_type 113542 32786581 32786939 32786826 L1M4 LINE/L1 113544 32792179 32792615 32792372 MSTB1 LTR/MaLR 113545 32792617 32793221 32792932 L1MD1 LINE/L1 113546 32801402 32801818 32801600 MLT1D LTR/MaLR 113547 32801402 32801818 32801736 MLT1D LTR/MaLR 113556 32811283 32811384 32811340 MIR SINE/MIR 113561 32825623 32825751 32825734 MIR SINE/MIR 113562 32825623 32825751 32825745 MIR SINE/MIR 113566 32846558 32846781 32846650 L1M4 LINE/L1 113582 32237234 32237539 32237387 AluY SINE/Alu 113584 19739919 19740059 19739944 MIR SINE/MIR 113585 19656379 19656545 19656511 L1MA10 LINE/L1 113586 19712158 19712608 19712224 L1MDa LINE/L1 113588 10006647 10006836 10006656 L1PB2 LINE/L1 113595 28838534 28838686 28838602 MIR SINE/MIR 113596 28838534 28838686 28838675 MIR SINE/MIR 113646 12402785 12403097 12402798 AluY SINE/Alu 113648 12354847 12355161 12354993 AluSx SINE/Alu 113649 24774701 24774991 24774820 AluSg SINE/Alu 113651 24931043 24931347 24931045 AluJb SINE/Alu 113654 24944776 24945042 24944803 AluJo SINE/Alu 113655 24818866 24818999 24818884 AluJb SINE/Alu 113656 24819003 24819281 24819263 AluSg SINE/Alu 113657 24819003 24819281 24819272 AluSg SINE/Alu 113658 24825170 24825484 24825377 AluY SINE/Alu 113661 24830634 24830846 24830737 L1MC5 LINE/L1 113662 24837425 24837724 24837623 AluSg SINE/Alu 113664 9752696 9752930 9752801 MIR SINE/MIR 113668 9760233 9760539 9760380 AluJo SINE/Alu 113669 9739762 9739995 9739957 MIR SINE/MIR 113670 9763681 9763784 9763709 MER117 DNA/MER1_type 113671 9763952 9764251 9764070 AluSx SINE/Alu 113676 9772201 9772353 9772309 MIR3 SINE/MIR 113677 9774567 9774823 9774816 MLT1G1 LTR/MaLR 113678 9792523 9792908 9792804 L1ME4a LINE/L1 113679 9792918 9793178 9793090 L2 LINE/L2 113680 9793779 9794083 9794041 AluSx SINE/Alu 113750 15406163 15406464 15406441 AluSx SINE/Alu 113752 15436961 15437745 15437731 L2 LINE/L2 113753 15343938 15344229 15344133 L2 LINE/L2 113756 15358116 15358143 15358134 AT_rich Low_complexity 113760 24546717 24547027 24546994 AluY SINE/Alu 113772 17664799 17665093 17664950 AluSq SINE/Alu 113781 30921882 30922029 30921892 MIR SINE/MIR 113782 30922178 30922639 30922448 MLT1J LTR/MaLR 113783 30922178 30922639 30922520 MLT1J LTR/MaLR 113789 30992738 30992986 30992986 L1MB8 LINE/L1 113791 30984227 30984922 30984898 HAL1 LINE/L1 113793 27277012 27277189 27277084 MIR SINE/MIR 113802 27165869 27166015 27165944 MIR SINE/MIR 113803 27166102 27166408 27166139 AluSx SINE/Alu 113804 27208834 27209174 27208839 C-rich Low_complexity 113805 27166439 27166704 27166460 L1ME4a LINE/L1 113806 27166439 27166704 27166613 L1ME4a LINE/L1 113807 27166439 27166704 27166666 L1ME4a LINE/L1 113813 30436837 30437001 30436901 MER58A DNA/MER1_type 113814 30436837 30437001 30436930 MER58A DNA/MER1_type 113815 30436837 30437001 30436946 MER58A DNA/MER1_type 113831 15503950 15504241 15504219 AluJb SINE/Alu 113895 32413586 32413757 32413738 (CTCA)n Simple_repeat 113896 32413586 32413757 32413743 (CTCA)n Simple_repeat 113901 32401850 32401987 32401893 MER31B LTR/ERV1 113907 32428035 32428325 32428088 AluSg1 SINE/Alu 113920 32460913 32461232 32461066 AluSx SINE/Alu 113928 32489695 32489780 32489704 L3 LINE/CR1 113942 32341974 32342395 32342264 Charlie4a DNA/MER1_type 114089 31807543 31807665 31807627 MIR SINE/MIR 114093 31722283 31722500 31722368 L1MB7 LINE/L1 114124 33647787 33647925 33647868 AluSx SINE/Alu 114125 33647926 33648233 33647995 AluSg SINE/Alu 114127 33667426 33667759 33667680 AluSx SINE/Alu 114128 33637001 33637302 33637157 AluY SINE/Alu 114129 33637001 33637302 33637231 AluY SINE/Alu 114132 33679374 33679608 33679505 MER58A DNA/MER1_type 114140 31406612 31406995 31406937 MLT1A2 LTR/MaLR 114142 31427973 31428329 31428198 THE1B LTR/MaLR 114143 31432270 31432565 31432301 AluSx SINE/Alu 114144 31432270 31432565 31432350 AluSx SINE/Alu 114146 31432270 31432565 31432550 AluSx SINE/Alu 114147 31391850 31392277 31392233 MLT1D LTR/MaLR 114148 31392282 31392419 31392381 MER5A DNA/MER1_type 114150 12668266 12668311 12668285 MER51A LTR/ERV1 114151 12669387 12669677 12669402 AluSg SINE/Alu 114152 12669687 12669855 12669699 MER47A DNA/MER2_type 114230 12523488 12523919 12523599 LTR54 LTR/ERV1 114278 31662548 31662741 31662734 MER3 DNA/MER1_type 114279 31662548 31662741 31662740 MER3 DNA/MER1_type 114281 31668520 31668935 31668901 L1MC4a LINE/L1 114283 31673578 31673666 31673595 L2 LINE/L2 114288 31593743 31593912 31593803 L1PA4 LINE/L1 114289 31593913 31594037 31594026 L1ME3A LINE/L1 114290 31602221 31603282 31602296 L2 LINE/L2 114291 31602221 31603282 31602527 L2 LINE/L2 114292 31602221 31603282 31602950 L2 LINE/L2 114293 31604366 31605278 31604507 L1MD2 LINE/L1 114294 31604366 31605278 31604923 L1MD2 LINE/L1 114298 31631599 31631812 31631796 LTR33 LTR/ERVL 114386 12632370 12632681 12632649 AluSx SINE/Alu 114387 12640560 12640591 12640561 (CA)n Simple_repeat 114389 12640898 12641201 12640919 AluSx SINE/Alu 114392 12531430 12531643 12531456 L1MB2 LINE/L1 114393 12526462 12526619 12526568 AluJo SINE/Alu 114602 11584433 11584840 11584476 L2 LINE/L2 114626 17453223 17453338 17453267 L2 LINE/L2 114627 17453340 17453645 17453530 MER2 DNA/MER2_type 114628 17453340 17453645 17453595 MER2 DNA/MER2_type 114635 11562091 11562391 11562100 AluSx SINE/Alu 114641 11545743 11545907 11545850 MIR SINE/MIR 114643 11574274 11574491 11574297 ORSL DNA/AcHobo 114644 11573445 11573709 11573483 AluY SINE/Alu 114645 11573445 11573709 11573482 AluY SINE/Alu 115068 7390708 7391655 7391635 L1MB4 LINE/L1 115070 7400742 7400937 7400909 MIR SINE/MIR 115075 7273070 7273658 7273215 Harlequin LTR/ERV1 115076 7273070 7273658 7273285 Harlequin LTR/ERV1 115079 7243116 7243418 7243311 AluJo SINE/Alu 115080 7282985 7283628 7283555 LTR6A LTR/ERV1 115081 7243116 7243418 7243403 AluJo SINE/Alu 115091 7335237 7335390 7335265 MIR SINE/MIR 115095 7431465 7431759 7431609 AluY SINE/Alu 115106 7561502 7561819 7561763 AluSx SINE/Alu 115114 7592455 7592696 7592543 L1PA16 LINE/L1 115121 7641386 7641641 7641497 MSTB1 LTR/MaLR 115124 7649837 7650148 7649974 AluSp SINE/Alu 115126 7687872 7687929 7687896 MIR SINE/MIR 115129 7698560 7698823 7698574 MER2 DNA/MER2_type 115131 7713395 7713479 7713409 AluSx SINE/Alu 115133 7714466 7714692 7714581 L2 LINE/L2 115134 7715630 7715733 7715690 CT-rich Low_complexity 115145 7764137 7764510 7764182 L1ME2 LINE/L1 115146 7786569 7786608 7786597 (TG)n Simple_repeat 115149 7805571 7805986 7805743 LTR19A LTR/ERV1 115153 8019203 8019413 8019324 MIR SINE/MIR 115160 8098824 8099120 8099004 AluSx SINE/Alu 115163 8308624 8309149 8308941 MLT1F1 LTR/MaLR 115170 8438045 8438097 8438082 MIR SINE/MIR 115184 8508407 8508672 8508546 AluSx SINE/Alu 115188 8511757 8512079 8512018 AluJo SINE/Alu 115195 8548562 8548867 8548573 AluSg SINE/Alu 115198 8565615 8565878 8565767 AluJo SINE/Alu 115199 8565974 8566071 8565998 FLAM_C SINE/Alu 115207 8573177 8573409 8573382 L1PA5 LINE/L1 115214 8729582 8730005 8729646 MSTB1 LTR/MaLR 115215 8695901 8696373 8696049 MER61E LTR/ERV1 115216 8695901 8696373 8695977 MER61E LTR/ERV1 115335 16867 17283 17168 MSTA LTR/MaLR 115336 16867 17283 17208 MSTA LTR/MaLR 115337 2201 2604 2513 MER4E LTR/ERV1 115339 28153 28278 28192 L2 LINE/L2 115340 28258 28386 28385 L2 LINE/L2 115355 95347 95990 95512 MER44D DNA/MER2_type 115358 104856 105150 104962 AluSq SINE/Alu 115362 105390 105670 105603 AluJo SINE/Alu 115363 138669 139569 139394 L1MA6 LINE/L1 115364 138669 139569 139450 L1MA6 LINE/L1 115365 138669 139569 139468 L1MA6 LINE/L1 115367 139578 139991 139779 L1MA6 LINE/L1 115368 140035 140293 140136 L1MA6 LINE/L1 115369 140035 140293 140175 L1MA6 LINE/L1 115374 198968 199471 199266 L1P4 LINE/L1 115375 232954 233121 233086 MER104 DNA/MER2_type 115376 202728 202802 202778 L1P5 LINE/L1 115377 269140 269346 269221 L1 LINE/L1 115391 287741 288251 287742 Tigger3b DNA/MER2_type 115392 287741 288251 287999 Tigger3b DNA/MER2_type 115404 367103 367311 367295 MIR SINE/MIR 115414 436519 436616 436585 MER58A DNA/MER1_type 115415 580769 582873 580970 L1MA9 LINE/L1 115416 610955 612022 611080 MER11C LTR/ERVK 115420 807015 807159 807074 L1M4c LINE/L1 115435 924117 924360 924322 L1ME1 LINE/L1 115438 957280 957587 957393 (CCCTG)n Simple_repeat 115445 1004285 1004454 1004403 MIR SINE/MIR 115453 5128951 5129238 5129200 AluSc SINE/Alu 115479 5635699 5635875 5635841 MER58B DNA/MER1_type 115480 5638944 5639103 5638972 AluSg/x SINE/Alu 115481 5638944 5639103 5639050 AluSg/x SINE/Alu 115484 5667451 5667846 5667581 L2 LINE/L2 115485 5809210 5809495 5809319 AluY SINE/Alu 115487 5844937 5845222 5845111 AluSc SINE/Alu 115815 6136704 6136809 6136782 L1 LINE/L1 115825 6691354 6691678 6691639 AluSx SINE/Alu 115828 6715153 6715364 6715251 MSTB1 LTR/MaLR 115833 6300786 6300925 6300839 L2 LINE/L2 115846 6105812 6106125 6105829 AluY SINE/Alu 115859 6452295 6452586 6452439 AluSx SINE/Alu 115860 6454526 6454639 6454612 AluJo SINE/Alu 115861 6454526 6454639 6454613 AluJo SINE/Alu 115867 5900208 5900356 5900239 L1ME4a LINE/L1 115868 5900208 5900356 5900296 L1ME4a LINE/L1 115879 6679329 6679528 6679443 LTR16A LTR/ERVL 115880 6681431 6681747 6681609 HERVL LTR/ERVL 115891 6247755 6248066 6247873 AluSp SINE/Alu 115895 6009334 6009484 6009471 L2 LINE/L2 115914 5939092 5939551 5939107 L1MCa LINE/L1 115916 6052175 6053409 6053192 HSREP522 Satellite/telo 115918 6075780 6076146 6075807 L1MC4 LINE/L1 116052 13303023 13303187 13303109 AluSc SINE/Alu 116058 3046656 3046715 3046708 AluSx SINE/Alu 116059 3046716 3047322 3046740 LTR12 LTR/ERV1 116266 7127490 7127594 7127545 AluSx SINE/Alu 116267 7142387 7142598 7142481 MER58A DNA/MER1_type 116268 7143770 7144243 7144039 L1ME LINE/L1 116269 7161953 7162193 7162008 AluJo SINE/Alu 116439 30667792 30667920 30667877 MER4C LTR/ERV1 116440 30667792 30667920 30667878 MER4C LTR/ERV1 116441 30668051 30668385 30668106 MER4A LTR/ERV1 116495 34277792 34278067 34277879 AluJb SINE/Alu 116507 34371630 34372201 34371786 LTR10C LTR/ERV1 116508 34369040 34369388 34369257 Tigger1 DNA/MER2_type 116509 34369040 34369388 34369238 Tigger1 DNA/MER2_type 116510 34369040 34369388 34369236 Tigger1 DNA/MER2_type 116511 34364385 34364695 34364441 AluY SINE/Alu 116512 34364385 34364695 34364404 AluY SINE/Alu 116513 34333848 34334137 34333853 AluSx SINE/Alu 116988 17697814 17698100 17697861 AluSp SINE/Alu 116991 18248052 18248159 18248058 MIR SINE/MIR 116992 18274734 18275223 18274822 MER31B LTR/ERV1 116994 18255536 18256013 18255718 L1ME3A LINE/L1 117004 17729456 17729619 17729490 AluSg/x SINE/Alu 117008 17711146 17711296 17711228 L2 LINE/L2 117009 17711146 17711296 17711229 L2 LINE/L2 117025 18336733 18337033 18336747 AluSq SINE/Alu 117026 18338975 18339978 18339906 L1MB1 LINE/L1 117027 18350837 18351064 18350932 MIR SINE/MIR 117040 17995526 17995762 17995618 AluSq SINE/Alu 117042 18018122 18018935 18018933 L1MDb LINE/L1 117046 17655795 17655932 17655818 MIR SINE/MIR 117047 17655795 17655932 17655827 MIR SINE/MIR 117048 17660304 17660610 17660442 AluSx SINE/Alu 117055 18118993 18119344 18119125 THE1B LTR/MaLR 117056 18120962 18121132 18121070 MIR SINE/MIR 117057 18122866 18123061 18122935 MIR SINE/MIR 117058 18122866 18123061 18122979 MIR SINE/MIR 117060 18102157 18103157 18103066 L1 LINE/L1 117061 18103377 18103533 18103496 AluY SINE/Alu 117063 18103773 18103972 18103931 MLT1L LTR/MaLR 117066 17652147 17652449 17652285 AluSx SINE/Alu 117081 18240538 18240726 18240591 L1MEc LINE/L1 117083 18230841 18233166 18231046 HERVL18 LTR/ERVL 117084 18242547 18242762 18242663 MIR SINE/MIR 117088 18230572 18230711 18230595 L1MB1 LINE/L1 117094 17523940 17524277 17524258 MLT1B LTR/MaLR 117101 17517063 17517565 17517159 LTR27 LTR/ERV1 117102 17517063 17517565 17517255 LTR27 LTR/ERV1 117158 18404482 18407189 18405538 MER66-int LTR/ERV1 117159 18404482 18407189 18406029 MER66-int LTR/ERV1 117160 18407190 18407537 18407387 THE1B LTR/MaLR 117162 18386543 18386671 18386633 CT-rich Low_complexity 117167 17829816 17830072 17830049 MIR SINE/MIR 117168 17830526 17830824 17830714 AluSg SINE/Alu 117173 17488794 17489288 17488925 L1ME1 LINE/L1 117174 17488794 17489288 17489050 L1ME1 LINE/L1 117175 17475032 17475373 17475099 MER2 DNA/MER2_type 117176 17475032 17475373 17475112 MER2 DNA/MER2_type 117177 17475032 17475373 17475113 MER2 DNA/MER2_type 117183 20446459 20446583 20446459 L2 LINE/L2 117186 20430071 20430113 20430072 (TG)n Simple_repeat 117188 31840146 31840529 31840514 MLT1A2 LTR/MaLR 117191 31863633 31863912 31863865 L1MC5 LINE/L1 117192 31863976 31864297 31864022 AluY SINE/Alu 117195 16389113 16389180 16389168 L2 LINE/L2 117206 32181178 32181499 32181339 AluSq SINE/Alu 117211 32182498 32182805 32182529 AluY SINE/Alu 117213 16638257 16638535 16638304 L3 LINE/CR1 117214 16627427 16627632 16627470 L2 LINE/L2 117215 16628154 16628304 16628230 MIR SINE/MIR 117221 16618479 16618578 16618491 MIR SINE/MIR 117223 16618703 16618818 16618817 MIR SINE/MIR 117233 20822327 20823631 20822504 MLT1F-int LTR/MaLR 117234 20822327 20823631 20822659 MLT1F-int LTR/MaLR 117235 17412216 17412548 17412277 MER7A DNA/MER2_type 117239 16688473 16688774 16688480 MER63B DNA/MER1_type 117240 16688473 16688774 16688562 MER63B DNA/MER1_type 117241 16689995 16690234 16690023 MIR SINE/MIR 117242 16691247 16691470 16691358 MIR SINE/MIR 117250 31771701 31772039 31771756 AluSg SINE/Alu 117256 16736242 16736598 16736561 L2 LINE/L2 117257 16736242 16736598 16736581 L2 LINE/L2 117259 16712376 16712430 16712387 L2 LINE/L2 117262 15939457 15939788 15939723 L2 LINE/L2 117264 17925443 17925885 17925802 Charlie4a DNA/MER1_type 117265 17926158 17926384 17926266 HAL1 LINE/L1 117266 17926385 17926680 17926552 AluJo SINE/Alu 117291 12183385 12183612 12183573 MIR SINE/MIR 117296 30789244 30789440 30789408 CT-rich Low_complexity 117298 30790172 30790633 30790469 MLT1E LTR/MaLR 117299 30795418 30796804 30795812 L1MEc LINE/L1 117300 30795418 30796804 30795881 L1MEc LINE/L1 117301 30795418 30796804 30796000 L1MEc LINE/L1 117311 20574031 20574196 20574052 MIR SINE/MIR 117312 20574031 20574196 20574156 MIR SINE/MIR 117316 16440165 16440659 16440341 L2 LINE/L2 117317 16440165 16440659 16440470 L2 LINE/L2 117322 16464725 16465678 16465677 L2 LINE/L2 117324 15975291 15975479 15975313 MER58A DNA/MER1_type 117325 15961223 15961618 15961246 MLT1B LTR/MaLR 117326 15961223 15961618 15961602 MLT1B LTR/MaLR 117327 15964742 15964833 15964794 MIR3 SINE/MIR 117329 31243097 31244653 31244281 L1MC3 LINE/L1 117330 31243097 31244653 31244044 L1MC3 LINE/L1 117331 30823410 30823495 30823475 MIR SINE/MIR 117332 30828175 30828288 30828235 L2 LINE/L2 117333 30845171 30845771 30845181 L1M4c LINE/L1 117334 30845171 30845771 30845284 L1M4c LINE/L1 117340 23044129 23044264 23044255 AluSq/x SINE/Alu 117343 28294782 28295096 28294795 AluSx SINE/Alu 117349 28277621 28277773 28277720 MIR SINE/MIR 117350 28277621 28277773 28277703 MIR SINE/MIR 117356 19482670 19482791 19482747 MIR SINE/MIR 117357 19458299 19458430 19458336 MIR SINE/MIR 117358 19458083 19458201 19458168 AluSg/x SINE/Alu 117359 19458083 19458201 19458083 AluSg/x SINE/Alu 117363 19225890 19226105 19226100 MIR SINE/MIR 117371 27242924 27243120 27242994 L2 LINE/L2 117374 27235802 27236114 27236043 AluSx SINE/Alu 117375 27235802 27236114 27235915 AluSx SINE/Alu 117379 27265874 27266205 27266097 L1M4c LINE/L1 117380 27265745 27265873 27265850 FLAM_C SINE/Alu 117382 17220204 17220486 17220225 AluSx SINE/Alu 117383 17228709 17228884 17228882 AluJo SINE/Alu 117384 26487876 26488118 26487983 LTR50 LTR/ERVL 117386 26494146 26494449 26494379 AluSp SINE/Alu 117387 26494982 26495239 26495219 MLT1L LTR/MaLR 117388 26469588 26469765 26469619 MIR SINE/MIR 117389 26469588 26469765 26469737 MIR SINE/MIR 117393 27863301 27863607 27863302 AluY SINE/Alu 117395 17392958 17393147 17393011 MIR SINE/MIR 117396 17394742 17395012 17394899 MLT1A1 LTR/MaLR 117397 17394742 17395012 17394973 MLT1A1 LTR/MaLR 117399 20796739 20797020 20796777 AluSq SINE/Alu 117401 20814221 20814731 20814561 L2 LINE/L2 117403 17911606 17911677 17911628 MER2 DNA/MER2_type 117404 31001384 31001596 31001389 MIR SINE/MIR 117405 31001708 31001880 31001754 MIR SINE/MIR 117406 20596921 20597158 20597066 L2 LINE/L2 117411 20650640 20650927 20650763 AluSx SINE/Alu 117417 21069992 21070173 21070013 MLT1J LTR/MaLR 117421 20991783 20992159 20992045 THE1C LTR/MaLR 117422 20972106 20972468 20972177 L2 LINE/L2 117423 20972106 20972468 20972357 L2 LINE/L2 117424 20972453 20972557 20972477 MIR SINE/MIR 117431 21032842 21033041 21032909 MER44D DNA/MER2_type 117433 21046220 21046398 21046286 MIR SINE/MIR 117435 33166890 33167769 33167579 L1MEc LINE/L1 117436 33167770 33168083 33167921 AluSx SINE/Alu 117437 33167770 33168083 33167985 AluSx SINE/Alu 117442 33194033 33194330 33194140 L2 LINE/L2 117448 33083989 33084429 33084162 MLT1C LTR/MaLR 117454 33103397 33104365 33104133 L1M2 LINE/L1 117460 33143242 33143612 33143307 L1MB3 LINE/L1 117473 18904721 18904839 18904733 MIR3 SINE/MIR 117474 18904721 18904839 18904749 MIR3 SINE/MIR 117479 18810729 18810879 18810742 MER45A DNA/AcHobo 117481 18794847 18795247 18794892 L1ME4a LINE/L1 117483 18850598 18850961 18850786 MLT1C LTR/MaLR 117487 18592609 18592842 18592738 MIR SINE/MIR 117488 18592609 18592842 18592775 MIR SINE/MIR 117492 18659470 18659937 18659762 MLT1H LTR/MaLR 117494 18660385 18660554 18660403 MIR SINE/MIR 117495 18664524 18664868 18664610 MLT1A2 LTR/MaLR 117496 17116612 17116935 17116848 L2 LINE/L2 117497 17001520 17001828 17001606 AluY SINE/Alu 117499 17057952 17058253 17058046 AluY SINE/Alu 117502 17061469 17061621 17061612 MIR SINE/MIR 117506 27529006 27529312 27529042 AluSx SINE/Alu 117507 27394771 27395100 27394924 L1ME2 LINE/L1 117508 27423763 27424169 27423917 MSTA LTR/MaLR 117509 27423763 27424169 27424063 MSTA LTR/MaLR 117510 27453199 27453509 27453411 AluSc SINE/Alu 117512 27477224 27477776 27477405 L1MCa LINE/L1 117516 27483606 27483898 27483815 MLT1A1 LTR/MaLR 117519 33065838 33066145 33065978 AluSx SINE/Alu 117523 32980132 32980421 32980287 THE1B LTR/MaLR 117525 32980523 32980678 32980557 (CTCA)n Simple_repeat 117526 32980523 32980678 32980576 (CTCA)n Simple_repeat 117539 33009393 33010804 33009876 L1M4 LINE/L1 117540 33009393 33010804 33009909 L1M4 LINE/L1 117541 33009393 33010804 33010111 L1M4 LINE/L1 117544 33028590 33028955 33028727 MLT1B LTR/MaLR 117545 33028590 33028955 33028728 MLT1B LTR/MaLR 117551 33045770 33046089 33046083 AluSx SINE/Alu 117560 23726903 23727268 23727059 L3 LINE/CR1 117576 26969903 26970201 26970106 AluSx SINE/Alu 117578 26969903 26970201 26970179 AluSx SINE/Alu 117597 27023605 27023851 27023774 L2 LINE/L2 117598 27031202 27031508 27031385 L2 LINE/L2 117599 27031202 27031508 27031388 L2 LINE/L2 117603 27043827 27044020 27043976 MIR SINE/MIR 117607 27046927 27047075 27046996 L3 LINE/CR1 117615 20213572 20213722 20213644 (CA)n Simple_repeat 117619 20106785 20107151 20106970 MLT1B LTR/MaLR 117620 20106785 20107151 20107073 MLT1B LTR/MaLR 117621 20106785 20107151 20107115 MLT1B LTR/MaLR 117624 20109116 20109370 20109212 MER77 LTR/ERV1 117625 20128942 20129254 20129172 AluSq SINE/Alu 117638 19243171 19243391 19243248 MIR SINE/MIR 117644 19295413 19295702 19295648 AluSg SINE/Alu 117646 19299156 19299189 19299159 (TTTTA)n Simple_repeat 117653 16507411 16507725 16507488 AluY SINE/Alu 117654 16490078 16490395 16490337 Tigger7 DNA/MER2_type 117655 32201238 32201570 32201432 MLT1B LTR/MaLR 117656 32201238 32201570 32201476 MLT1B LTR/MaLR 117662 18056027 18056326 18056036 AluY SINE/Alu 117663 18056027 18056326 18056084 AluY SINE/Alu 117664 18056027 18056326 18056206 AluY SINE/Alu 117682 31022186 31022485 31022241 AluY SINE/Alu 117683 31022186 31022485 31022362 AluY SINE/Alu 117693 31054437 31054575 31054481 CT-rich Low_complexity 117694 31056167 31056241 31056181 MIR SINE/MIR 117701 31079661 31080097 31080073 L1ME1 LINE/L1 117719 28694767 28695080 28694859 AluSx SINE/Alu 117720 28703185 28703345 28703300 AluSq SINE/Alu 117725 28727260 28727424 28727354 MIR3 SINE/MIR 117727 16049118 16049350 16049329 L1MB8 LINE/L1 117730 25533234 25533539 25533465 AluSp SINE/Alu 117732 25541983 25542281 25542144 AluSg SINE/Alu 117733 25543437 25543607 25543553 MER104 DNA/MER2_type 117734 25543645 25543905 25543792 AluY SINE/Alu 117737 25427505 25427757 25427704 AluSq SINE/Alu 117738 25485718 25486028 25485767 AluSp SINE/Alu 117742 25515779 25516084 25516006 AluSc SINE/Alu 117744 25517206 25517500 25517452 AluSx SINE/Alu 117751 21564911 21565117 21565102 L2 LINE/L2 117752 21577567 21577873 21577599 AluSc SINE/Alu 117756 21600990 21601298 21601229 AluSq SINE/Alu 117759 21471702 21471831 21471745 AluJo SINE/Alu 117768 16994502 16994801 16994658 AluSq SINE/Alu 117769 16887920 16888221 16888039 AluSx SINE/Alu 117771 16892081 16892203 16892120 MIR3 SINE/MIR 117774 16896112 16896413 16896120 AluY SINE/Alu 117775 16903214 16903582 16903407 THE1C LTR/MaLR 117777 16924110 16924487 16924208 MLT1H LTR/MaLR 117779 16952017 16952269 16952031 L2 LINE/L2 117780 16966732 16967037 16966784 AluY SINE/Alu 117791 26079658 26079876 26079835 MIR SINE/MIR 117811 26136824 26137166 26136937 L2 LINE/L2 117812 26150179 26150283 26150235 MIR SINE/MIR 117815 18954313 18954527 18954445 MIR SINE/MIR 117818 32554042 32554421 32554043 L1MD2 LINE/L1 117819 32560809 32561090 32560822 MLT1C LTR/MaLR 117828 32275117 32275284 32275189 MER77 LTR/ERV1 117832 32254310 32254588 32254536 AluJo SINE/Alu 117833 32253828 32253915 32253853 CT-rich Low_complexity 117843 29647954 29648093 29648057 HAL1 LINE/L1 117888 31206725 31206833 31206755 AT_rich Low_complexity 117889 31206918 31207389 31207184 MLT1G1 LTR/MaLR 117917 28220719 28220834 28220769 MIR SINE/MIR 117986 21236806 21236837 21236814 GC_rich Low_complexity 117987 21231495 21231649 21231644 MIR SINE/MIR 117988 21231495 21231649 21231574 MIR SINE/MIR 117991 21222761 21223077 21222949 AluJb SINE/Alu 117992 21211730 21212058 21211835 AluSg SINE/Alu 117994 26378019 26378334 26378235 AluY SINE/Alu 117996 26426708 26426994 26426766 AluSc SINE/Alu 117997 26426708 26426994 26426891 AluSc SINE/Alu 117998 26426708 26426994 26426954 AluSc SINE/Alu 118012 28574956 28575067 28574986 MIR SINE/MIR 118014 28564145 28564471 28564424 AluSx SINE/Alu 118015 28564473 28564592 28564491 L1MB7 LINE/L1 118016 28564473 28564592 28564508 L1MB7 LINE/L1 118017 28590149 28590448 28590387 AluJb SINE/Alu 118021 28566864 28567103 28566922 L2 LINE/L2 118022 28566864 28567103 28566977 L2 LINE/L2 118029 28641073 28641480 28641121 MLT1C LTR/MaLR 118036 24036001 24036143 24036142 L2 LINE/L2 118038 24092314 24092515 24092356 L1MB3 LINE/L1 118039 24092547 24092840 24092574 AluSq SINE/Alu 118042 24108781 24109072 24109036 AluSx SINE/Alu 118045 29599843 29599938 29599908 L2 LINE/L2 118048 12754062 12754176 12754080 MIR3 SINE/MIR 118049 12754275 12754535 12754434 AluJo SINE/Alu 118050 12806917 12807204 12807100 AluSx SINE/Alu 118059 21107403 21107715 21107577 AluY SINE/Alu 118061 21149110 21149300 21149121 MIR SINE/MIR 118062 21162205 21162349 21162325 MIR3 SINE/MIR 118064 21163887 21164186 21164179 AluSq SINE/Alu 118067 21174809 21175157 21174866 L3 LINE/CR1 118068 21178557 21179172 21179139 MER115 DNA/AcHobo 118071 21186951 21187090 21187063 MIR3 SINE/MIR 118076 32924166 32924986 32924172 L1ME1 LINE/L1 118081 32927056 32927268 32927145 L1M4 LINE/L1 118093 12849367 12849748 12849544 MLT1B LTR/MaLR 118095 19988884 19989164 19989164 MER77 LTR/ERV1 118103 19990417 19990728 19990424 AluY SINE/Alu 118104 19990417 19990728 19990551 AluY SINE/Alu 118105 19990417 19990728 19990715 AluY SINE/Alu 118110 19999384 19999973 19999708 MER4B LTR/ERV1 118111 20005363 20005483 20005435 MIR3 SINE/MIR 118120 20048133 20048440 20048408 AluY SINE/Alu 118121 20048133 20048440 20048414 AluY SINE/Alu 118124 20070646 20070944 20070891 AluJb SINE/Alu 118125 20070646 20070944 20070894 AluJb SINE/Alu 118127 19864306 19864602 19864555 AluSx SINE/Alu 118128 19904093 19904381 19904257 AluY SINE/Alu 118129 19930517 19930563 19930522 MIR SINE/MIR 118130 19933121 19933439 19933298 AluSq SINE/Alu 118131 19949644 19949955 19949667 AluSx SINE/Alu 118132 19949644 19949955 19949692 AluSx SINE/Alu 118133 19949644 19949955 19949710 AluSx SINE/Alu 118134 19949991 19950431 19950263 LTR16C LTR/ERVL 118140 19959512 19959633 19959599 L1M4 LINE/L1 118142 10600260 10600553 10600427 AluSx SINE/Alu 118143 10600554 10600913 10600579 L2 LINE/L2 118151 13164313 13164622 13164463 AluSx SINE/Alu 118153 13065785 13065822 13065821 (TA)n Simple_repeat 118158 13137557 13137834 13137759 AluJo SINE/Alu 118160 13139463 13139624 13139477 MIR SINE/MIR 118188 29402131 29402286 29402167 MIR3 SINE/MIR 118189 29405402 29405657 29405640 MIR SINE/MIR 118192 29410120 29410355 29410153 L1MC5 LINE/L1 118199 29433047 29433322 29433239 (TGGA)n Simple_repeat 118200 29433340 29433428 29433349 (TGGA)n Simple_repeat 118201 29433340 29433428 29433413 (TGGA)n Simple_repeat 118203 29452701 29453204 29452821 REP3 LTR/ERV 118210 29480421 29480662 29480626 AluSx SINE/Alu 118220 10715259 10715574 10715267 AluSg SINE/Alu 118221 10715259 10715574 10715287 AluSg SINE/Alu 118222 10728583 10728896 10728613 AluJb SINE/Alu 118223 10728583 10728896 10728854 AluJb SINE/Alu 118224 10769765 10769921 10769834 MIR SINE/MIR 118237 27669206 27669816 27669230 LTR1B LTR/ERV1 118239 27693319 27693677 27693373 THE1C LTR/MaLR 118240 27697981 27698367 27698253 L3 LINE/CR1 118246 27712792 27713094 27713041 AluSx SINE/Alu 118253 27714851 27715159 27715051 AluSx SINE/Alu 118254 27715329 27715540 27715350 AluJo SINE/Alu 118255 27716955 27717232 27717119 AluSx SINE/Alu 118257 27591850 27592204 27592032 L2 LINE/L2 118260 27646341 27646418 27646396 L2 LINE/L2 118261 27646341 27646418 27646418 L2 LINE/L2 118269 22290161 22290340 22290166 AluJo SINE/Alu 118272 22302548 22302580 22302567 AT_rich Low_complexity 118283 33439101 33439407 33439375 AluSx SINE/Alu 118291 33464436 33464747 33464513 AluSx SINE/Alu 118300 33402513 33403177 33402597 L1ME1 LINE/L1 118324 10901273 10901415 10901366 MIR SINE/MIR 118327 10902180 10902717 10902540 MLT1K LTR/MaLR 118328 10910075 10910223 10910218 MIR SINE/MIR 118330 10910363 10910478 10910440 L2 LINE/L2 118332 10912845 10913437 10913019 MER44D DNA/MER2_type 118333 10912845 10913437 10913173 MER44D DNA/MER2_type 118337 10806332 10806652 10806566 LTR16A LTR/ERVL 118339 10807176 10807238 10807200 MIR SINE/MIR 118340 10807176 10807238 10807209 MIR SINE/MIR 118343 10960089 10960271 10960235 MIR SINE/MIR 118344 10813069 10813250 10813082 MIR SINE/MIR 118345 10813622 10813806 10813676 MLT1K LTR/MaLR 118351 10872337 10872684 10872469 L1PA13 LINE/L1 118353 10883318 10883429 10883338 MER81 DNA 118354 10883318 10883429 10883369 MER81 DNA 118358 21610842 21611115 21610949 AluJo SINE/Alu 118359 21632808 21632944 21632935 CT-rich Low_complexity 118360 21614426 21614478 21614442 L1MA1 LINE/L1 118449 24653042 24653342 24653164 AluY SINE/Alu 118450 24653042 24653342 24653209 AluY SINE/Alu 118451 24653042 24653342 24653304 AluY SINE/Alu 118478 16783932 16784229 16784054 AluSx SINE/Alu 118481 16802501 16802934 16802729 MLT1J2 LTR/MaLR 118482 16802501 16802934 16802853 MLT1J2 LTR/MaLR 118483 16802501 16802934 16802854 MLT1J2 LTR/MaLR 118484 16839840 16842711 16839846 L1PA5 LINE/L1 118512 28516089 28516218 28516202 L2 LINE/L2 118518 28559615 28560208 28559805 MER51A LTR/ERV1 118519 28559615 28560208 28560061 MER51A LTR/ERV1 118581 9963988 9964039 9964015 MER45A DNA/AcHobo 118582 9964042 9964330 9964077 AluSx SINE/Alu 118584 9819178 9819289 9819228 L2 LINE/L2 118585 9819594 9819747 9819721 MIR SINE/MIR 118587 9847153 9847535 9847222 MER96B DNA/MER1_type? 118590 9881998 9882226 9882059 L1MC4a LINE/L1 118591 9887991 9888196 9888189 MIR SINE/MIR 118592 9887991 9888196 9888194 MIR SINE/MIR 118615 10405427 10405518 10405510 (CATA)n Simple_repeat 118616 10405500 10405679 10405552 (TA)n Simple_repeat 118617 10405500 10405679 10405678 (TA)n Simple_repeat 118618 10412054 10412341 10412211 AluJb SINE/Alu 118621 10435681 10435862 10435692 L1M3 LINE/L1 118632 25686350 25686654 25686372 AluSq SINE/Alu 118634 25803358 25803670 25803663 AluY SINE/Alu 118635 25803671 25803876 25803671 AluJo SINE/Alu 118636 25810527 25810663 25810564 FLAM_C SINE/Alu 118638 25819171 25819480 25819241 AluSx SINE/Alu 118639 25819171 25819480 25819472 AluSx SINE/Alu 118642 25820522 25820859 25820552 HSMAR2 DNA/Mariner 118643 25833151 25833581 25833231 L1MB2 LINE/L1 118654 19028286 19028580 19028389 AluSx SINE/Alu 118655 19028286 19028580 19028508 AluSx SINE/Alu 118658 19028870 19029511 19028953 L2 LINE/L2 118662 19075600 19076214 19075848 L2 LINE/L2 118664 19080154 19080709 19080486 L1PA7 LINE/L1 118671 27093154 27093376 27093301 L2 LINE/L2 118681 27089524 27089569 27089536 (CAT)n Simple_repeat 118698 10644816 10644925 10644892 L2 LINE/L2 118699 10645329 10645457 10645435 L2 LINE/L2 118700 10645850 10646140 10645879 Charlie1b DNA/MER1_type 118703 10651924 10652225 10652085 AluJo SINE/Alu 118704 10651924 10652225 10652098 AluJo SINE/Alu 118711 9169028 9169155 9169135 MIR3 SINE/MIR 121526 6768477 6768800 6768712 ERVL LTR/ERVL 122160 8929464 8929648 8929593 MIR SINE/MIR 122279 2007426 2007738 2007724 AluSx SINE/Alu 123505 33237023 33237382 33237103 L1MDa LINE/L1 124320 22651522 22651727 22651572 MIR SINE/MIR 124758 23086865 23087183 23087168 AluSq SINE/Alu 125096 20680195 20680282 20680226 MIR SINE/MIR 125507 7225739 7225857 7225753 FLAM_A SINE/Alu 125835 16311858 16312156 16311927 AluSc SINE/Alu 126495 15418245 15418278 15418264 AT_rich Low_complexity 127276 30961660 30961680 30961678 GC_rich Low_complexity 127334 15643934 15644232 15644229 AluSx SINE/Alu 127335 15643934 15644232 15644227 AluSx SINE/Alu 127488 26911963 26912299 26912126 AluSx SINE/Alu 127489 26911963 26912299 26912110 AluSx SINE/Alu 128198 9523385 9523717 9523695 AluSx SINE/Alu 128973 1670518 1670812 1670669 AluSg SINE/Alu 129589 15965725 15965975 15965734 AluJo SINE/Alu 129590 15965725 15965975 15965733 AluJo SINE/Alu 130797 33155758 33155786 33155779 (ATATG)n Simple_repeat 130798 33155447 33155757 33155641 AluY SINE/Alu 130799 33155447 33155757 33155621 AluY SINE/Alu 131130 4509075 4509374 4509142 AluSq SINE/Alu 131385 21471844 21472093 21471886 L2 LINE/L2 132308 6679329 6679528 6679414 LTR16A LTR/ERVL 133035 3804298 3804598 3804578 AluY SINE/Alu 133385 9472070 9472371 9472182 AluJo SINE/Alu 134181 29336625 29336822 29336749 L1ME4a LINE/L1 134564 31361420 31361507 31361506 MER34C LTR/ERV1 134586 4809395 4809691 4809416 AluSq SINE/Alu 135009 18962703 18962873 18962750 MIR SINE/MIR 135486 5808844 5809150 5809140 AluSq SINE/Alu 137673 145924 146099 145953 HERV16 LTR/ERVL 138010 34551892 34552447 34552158 MER34C LTR/ERV1 138011 34551892 34552447 34552108 MER34C LTR/ERV1 138611 28417652 28418158 28417963 MLT1J LTR/MaLR 138612 28417652 28418158 28417893 MLT1J LTR/MaLR 140534 2756194 2756623 2756477 LTR56 LTR/ERV1 141328 5961607 5961782 5961633 L2 LINE/L2 141329 5961607 5961782 5961646 L2 LINE/L2 141330 5961607 5961782 5961647 L2 LINE/L2 141331 5961607 5961782 5961747 L2 LINE/L2 142447 8565949 8565969 8565962 AT_rich Low_complexity 142762 9964933 9964978 9964944 (CA)n Simple_repeat 142763 9964933 9964978 9964956 (CA)n Simple_repeat 142829 18123066 18123202 18123137 MIR SINE/MIR 145365 21230990 21231323 21231323 L2 LINE/L2 145366 21230990 21231323 21231235 L2 LINE/L2 145367 21231346 21231389 21231358 L2 LINE/L2 146188 26970666 26970983 26970703 AluSc SINE/Alu 147055 14201372 14201658 14201512 AluJo SINE/Alu 147274 23840218 23840244 23840239 (CTG)n Simple_repeat 147340 19992078 19992255 19992215 MER112 DNA/MER1_type 147607 24677527 24677733 24677668 AluJb SINE/Alu 148341 6105812 6106125 6106097 AluY SINE/Alu 148362 1117405 1118443 1118150 L2 LINE/L2 148441 26254822 26255115 26254828 AluJo SINE/Alu 150011 25938756 25939624 25939503 HAL1 LINE/L1 150324 20405063 20405222 20405140 MIR SINE/MIR 150512 30325952 30326266 30326247 AluSp SINE/Alu 151732 15480608 15480921 15480796 AluSx SINE/Alu 151949 11874374 11874535 11874496 L1MC5 LINE/L1 152069 31445254 31445619 31445533 L1 LINE/L1 152468 25270796 25270990 25270966 AluSg/x SINE/Alu 153055 1497985 1499475 1499143 L1 LINE/L1 153203 18498773 18498989 18498828 L1MC4 LINE/L1 153397 1981643 1981934 1981658 AluY SINE/Alu 153398 1982001 1982165 1982136 MER47A DNA/MER2_type 153412 3804298 3804598 3804577 AluY SINE/Alu 153415 3203140 3203422 3203172 L2 LINE/L2 153429 4034134 4034360 4034216 AluJo SINE/Alu 153430 4034134 4034360 4034253 AluJo SINE/Alu 153432 11695457 11695500 11695479 (TC)n Simple_repeat 153782 4715387 4715564 4715419 MER105 DNA 153783 4748631 4749178 4748939 L3 LINE/CR1 153804 4977953 4978253 4977995 AluSg SINE/Alu 154041 4501175 4501467 4501449 AluSc SINE/Alu 154048 4480265 4480403 4480269 MIR SINE/MIR 154049 4480265 4480403 4480376 MIR SINE/MIR 154558 13667233 13667421 13667385 MIR3 SINE/MIR 154944 1545858 1545911 1545862 GA-rich Low_complexity 154945 1617042 1617132 1617083 L2 LINE/L2 155024 287741 288251 288011 Tigger3b DNA/MER2_type 155118 4386752 4387211 4386913 LTR43 LTR/ERV1 155120 4324462 4324644 4324622 MIR SINE/MIR 155155 13493800 13494487 13494413 L2 LINE/L2 155418 3827549 3827598 3827567 MIR SINE/MIR 156434 4573858 4573920 4573866 MIR SINE/MIR 156662 2755192 2755673 2755592 REP3 LTR/ERV 156917 5018268 5018565 5018424 AluSx SINE/Alu 157254 5295545 5295704 5295561 AluSx SINE/Alu 157364 2673067 2673107 2673093 (TTTG)n Simple_repeat 163772 5282497 5282539 5282537 AluJb SINE/Alu 165073 2672970 2673066 2673062 FRAM SINE/Alu 165074 2672970 2673066 2673042 FRAM SINE/Alu 165798 5281995 5282178 5282018 AluSg/x SINE/Alu 166416 5881082 5881185 5881155 MIR SINE/MIR 166421 5961607 5961782 5961714 L2 LINE/L2 166426 5958113 5958237 5958235 L1MCa LINE/L1 167019 22266608 22266662 22266654 MIR SINE/MIR 167545 6425737 6426297 6426290 L1MB5 LINE/L1 167546 15154357 15154666 15154498 AluSg SINE/Alu 168806 23316332 23316445 23316412 MIR SINE/MIR 172645 18350432 18350731 18350701 AluSq SINE/Alu 172646 18350432 18350731 18350698 AluSq SINE/Alu 172647 18350432 18350731 18350673 AluSq SINE/Alu 172652 18240538 18240726 18240625 L1MEc LINE/L1 172654 18363002 18363363 18363308 L2 LINE/L2 172655 18230841 18233166 18230968 HERVL18 LTR/ERVL 172656 18230572 18230711 18230615 L1MB1 LINE/L1 181176 17888576 17888687 17888617 L2 LINE/L2 184465 25236387 25236413 25236403 (A)n Simple_repeat 189945 21777714 21778022 21777995 AluY SINE/Alu 190155 24163011 24163142 24163035 FLAM_C SINE/Alu 190156 24163011 24163142 24163050 FLAM_C SINE/Alu 190591 22696152 22696321 22696271 LTR16A1 LTR/ERVL 190609 19230776 19230852 19230848 MIR SINE/MIR 190611 19235315 19235603 19235375 AluY SINE/Alu 190612 20681155 20681354 20681341 MER20 DNA/MER1_type 190615 20744810 20744917 20744855 L2 LINE/L2 190616 11046478 11046665 11046546 MIR SINE/MIR 190617 11046478 11046665 11046640 MIR SINE/MIR 190618 11046666 11046711 11046672 (TTA)n Simple_repeat 190625 15866199 15866497 15866348 AluY SINE/Alu 190626 15866199 15866497 15866396 AluY SINE/Alu 190637 32045798 32045911 32045836 (CA)n Simple_repeat 190638 32045798 32045911 32045868 (CA)n Simple_repeat 190640 12290683 12290919 12290778 MER45C DNA/AcHobo 190644 16088496 16088541 16088513 (CA)n Simple_repeat 190685 11302309 11302485 11302328 MER45A DNA/AcHobo 190686 11302309 11302485 11302422 MER45A DNA/AcHobo 190739 30376240 30376421 30376409 L1M3 LINE/L1 190740 30376240 30376421 30376361 L1M3 LINE/L1 190757 18555025 18555113 18555062 MIR SINE/MIR 190758 18555025 18555113 18555092 MIR SINE/MIR 190932 26940736 26941040 26940925 AluJb SINE/Alu 190947 23280021 23280193 23280035 MIR SINE/MIR 190948 20265716 20265866 20265720 MIR SINE/MIR 190949 20265456 20265632 20265486 MIR SINE/MIR 190951 21318533 21318645 21318585 MIR SINE/MIR 190953 23452640 23452968 23452715 L2 LINE/L2 190956 21916128 21916434 21916279 AluSx SINE/Alu 190958 9020112 9020229 9020200 MIR SINE/MIR 190962 23159125 23159506 23159291 MLT1H1 LTR/MaLR 190963 23159125 23159506 23159367 MLT1H1 LTR/MaLR 190964 23159507 23159628 23159591 L2 LINE/L2 190970 34051619 34051911 34051667 AluY SINE/Alu 190971 34051619 34051911 34051675 AluY SINE/Alu 190972 34051619 34051911 34051697 AluY SINE/Alu 190973 34068280 34068330 34068314 L2 LINE/L2 190975 33915476 33915651 33915555 MIR SINE/MIR 190976 33915476 33915651 33915606 MIR SINE/MIR 190977 33915476 33915651 33915634 MIR SINE/MIR 190982 11608763 11608846 11608818 MIR SINE/MIR 190984 11608916 11609020 11608963 MIR SINE/MIR 190987 11667217 11667358 11667301 MIR3 SINE/MIR 190988 11667430 11667619 11667560 MIR SINE/MIR 190991 28417652 28418158 28418060 MLT1J LTR/MaLR 190992 28417652 28418158 28418083 MLT1J LTR/MaLR 190993 19425790 19425863 19425812 MIR SINE/MIR 190995 14617844 14618148 14618106 AluSx SINE/Alu 191045 25348386 25348590 25348566 L2 LINE/L2 191101 33486332 33486642 33486338 AluY SINE/Alu 191208 21809016 21809191 21809070 MIR SINE/MIR 191210 27966213 27966392 27966368 (CA)n Simple_repeat 191214 27974859 27975032 27974967 (TG)n Simple_repeat 191216 30248014 30248319 30248042 AluSg SINE/Alu 191217 30248014 30248319 30248029 AluSg SINE/Alu 191220 30213027 30213204 30213154 (CA)n Simple_repeat 191223 30212278 30212587 30212330 AluY SINE/Alu 191357 27374050 27374486 27374457 MER83 LTR/ERV1 191358 23026018 23026532 23026266 MLT1L LTR/MaLR 191572 27767008 27767319 27767202 AluSp SINE/Alu 191851 26504516 26504713 26504697 MLT2B1 LTR/ERVL 191855 28890803 28890993 28890964 L2 LINE/L2 191856 28890803 28890993 28890978 L2 LINE/L2 191857 28891215 28891498 28891367 MER4A LTR/ERV1 191858 28891215 28891498 28891397 MER4A LTR/ERV1 191945 29875876 29875965 29875876 L2 LINE/L2 192010 11413262 11413411 11413346 MIR SINE/MIR 192012 11406292 11406589 11406503 L2 LINE/L2 192203 9768756 9768911 9768839 MIR SINE/MIR 192206 9781763 9781989 9781884 MIR SINE/MIR 192284 32474660 32474734 32474664 (TG)n Simple_repeat 192293 32341974 32342395 32342356 Charlie4a DNA/MER1_type 192548 31691993 31692240 31692002 MER46C DNA/MER2_type 192549 31694859 31695080 31695008 MIR SINE/MIR 192678 30571629 30571745 30571681 L2 LINE/L2 192679 30571629 30571745 30571683 L2 LINE/L2 192680 30571629 30571745 30571704 L2 LINE/L2 193798 17417587 17417626 17417596 (TG)n Simple_repeat 199924 7224085 7224391 7224222 AluY SINE/Alu 199934 7428477 7428586 7428487 MIR3 SINE/MIR 199935 7428477 7428586 7428540 MIR3 SINE/MIR 199936 7428477 7428586 7428569 MIR3 SINE/MIR 199950 7626889 7627159 7627023 AluJb SINE/Alu 199953 7832094 7832346 7832222 MER84-int LTR/ERV1 199954 7804405 7804934 7804541 MLT1E2 LTR/MaLR 199955 7805571 7805986 7805813 LTR19A LTR/ERV1 199959 7913644 7913805 7913683 MER117 DNA/MER1_type 199988 6858569 6858709 6858619 (CA)n Simple_repeat 199989 6858569 6858709 6858700 (CA)n Simple_repeat 200079 19642 20323 19707 L1PA15-16 LINE/L1 200080 19642 20323 19771 L1PA15-16 LINE/L1 200094 95347 95990 95649 MER44D DNA/MER2_type 200095 95347 95990 95673 MER44D DNA/MER2_type 200096 95347 95990 95781 MER44D DNA/MER2_type 200101 157929 158115 157999 MER3 DNA/MER1_type 200102 157929 158115 158052 MER3 DNA/MER1_type 200103 157929 158115 158095 MER3 DNA/MER1_type 200117 262516 263220 262929 LTR8 LTR/ERV1 200118 262516 263220 263071 LTR8 LTR/ERV1 200119 262516 263220 263072 LTR8 LTR/ERV1 200120 262516 263220 263159 LTR8 LTR/ERV1 200121 262516 263220 263193 LTR8 LTR/ERV1 200122 262516 263220 263200 LTR8 LTR/ERV1 200209 5555478 5555768 5555682 AluSp SINE/Alu 200212 5606142 5606443 5606407 AluJb SINE/Alu 200243 5458844 5459176 5459026 AluSq SINE/Alu 200244 5458844 5459176 5459121 AluSq SINE/Alu 200513 5905252 5905554 5905515 AluSx SINE/Alu 200534 6180086 6180244 6180183 (TA)n Simple_repeat 200735 30676665 30676718 30676695 CT-rich Low_complexity 201038 17685109 17685416 17685271 AluSg SINE/Alu 201039 17685109 17685416 17685387 AluSg SINE/Alu 201042 18247183 18247247 18247231 MIR SINE/MIR 201043 18247279 18247395 18247323 L1PA4 LINE/L1 201050 17849621 17850072 17849941 MLT2A2 LTR/ERVL 201087 16572755 16572900 16572845 L2 LINE/L2 201088 16588263 16588555 16588550 AluSx SINE/Alu 201089 16588556 16588768 16588598 MLT1A1 LTR/MaLR 201096 32169427 32169726 32169657 AluSx SINE/Alu 201099 20818401 20818644 20818417 MIR SINE/MIR 201102 17958204 17958335 17958220 MIR3 SINE/MIR 201117 23032029 23032379 23032319 AluYb8 SINE/Alu 201118 23032029 23032379 23032123 AluYb8 SINE/Alu 201119 23032029 23032379 23032116 AluYb8 SINE/Alu 201120 23032029 23032379 23032070 AluYb8 SINE/Alu 201128 20656045 20656318 20656229 AluSx SINE/Alu 201129 20662920 20663219 20663190 AluSc SINE/Alu 201147 32994967 32995259 32994987 AluSc SINE/Alu 201148 32994967 32995259 32994998 AluSc SINE/Alu 201149 32994967 32995259 32995130 AluSc SINE/Alu 201151 33005295 33005608 33005392 AluSx SINE/Alu 201161 26970666 26970983 26970964 AluSc SINE/Alu 201173 20083098 20083398 20083205 AluJo SINE/Alu 201176 19313875 19313992 19313901 MIR SINE/MIR 201177 16492851 16493155 16492868 AluSp SINE/Alu 201178 16492851 16493155 16492917 AluSp SINE/Alu 201181 20487832 20488129 20487954 AluSg SINE/Alu 201182 20487832 20488129 20487842 AluSg SINE/Alu 201191 28706669 28706982 28706932 AluSx SINE/Alu 201197 16982325 16982594 16982543 L2 LINE/L2 201200 26168456 26168766 26168528 AluSx SINE/Alu 201201 26168456 26168766 26168529 AluSx SINE/Alu 201207 32302277 32302408 32302401 MIR SINE/MIR 201213 29699409 29699563 29699422 L1PA2 LINE/L1 201252 24470599 24470894 24470794 AluSg SINE/Alu 201268 21248069 21248172 21248115 MIR SINE/MIR 201270 21247774 21247972 21247818 L2 LINE/L2 201271 21247287 21247589 21247501 AluSx SINE/Alu 201273 21230591 21230669 21230638 MIR SINE/MIR 201275 21230275 21230492 21230469 AluJb SINE/Alu 201276 21230275 21230492 21230345 AluJb SINE/Alu 201277 21230275 21230492 21230302 AluJb SINE/Alu 201289 29941817 29942099 29941889 AluSx SINE/Alu 201300 20001784 20002078 20002043 AluJo SINE/Alu 201303 20007372 20007825 20007407 LTR3 LTR/ERVK 201304 20007372 20007825 20007582 LTR3 LTR/ERVK 201309 19950732 19950879 19950823 AluSc SINE/Alu 201311 13061363 13061531 13061477 MIR SINE/MIR 201312 13068718 13070184 13069228 L1ME1 LINE/L1 201313 13100316 13100446 13100356 (CA)n Simple_repeat 201314 13100918 13101218 13101126 AluJo SINE/Alu 201321 13148416 13148694 13148605 L2 LINE/L2 201350 27697981 27698367 27698318 L3 LINE/CR1 201351 27700149 27700295 27700222 LTR33 LTR/ERVL 201357 33402251 33402504 33402406 L1ME1 LINE/L1 201371 10880916 10881183 10881015 AluJo SINE/Alu 201372 10880916 10881183 10881150 AluJo SINE/Alu 201397 24626889 24627001 24626982 MER21B LTR/ERV1 201408 16818980 16819026 16818983 L2 LINE/L2 201409 16818980 16819026 16819021 L2 LINE/L2 201465 19046175 19046457 19046421 AluSx SINE/Alu 201491 2761650 2761857 2761724 L1MC4 LINE/L1 201837 1347978 1348435 1348164 L1MEc LINE/L1 201842 10412525 10412655 10412553 MIR3 SINE/MIR 201843 10412054 10412341 10412313 AluJb SINE/Alu 201893 28186640 28186876 28186827 MIR SINE/MIR 202571 9051205 9051476 9051213 AluSx SINE/Alu 202817 30789244 30789440 30789383 CT-rich Low_complexity 202818 30789244 30789440 30789381 CT-rich Low_complexity 202819 30789244 30789440 30789373 CT-rich Low_complexity 202914 13714274 13714580 13714569 AluSq SINE/Alu 203130 11509487 11509578 11509574 MIR3 SINE/MIR 203387 25878536 25878841 25878776 AluSx SINE/Alu 204218 4890145 4890447 4890174 AluSx SINE/Alu 204253 11057035 11057214 11057213 (TGGA)n Simple_repeat 204650 15055458 15055751 15055739 AluJo SINE/Alu 205232 26938580 26938758 26938625 AluY SINE/Alu 205233 26938580 26938758 26938667 AluY SINE/Alu 205462 1245015 1245493 1245454 L1MD1 LINE/L1 205493 8558939 8559062 8559023 MIR3 SINE/MIR 205536 17855445 17855815 17855634 L2 LINE/L2 205561 7463733 7464156 7464052 LTR5 LTR/ERVK 205611 12955370 12955533 12955498 AluSp/q SINE/Alu 205612 12956175 12956461 12956436 L1ME1 LINE/L1 205622 29363745 29363861 29363835 AluJb SINE/Alu 205690 31691845 31691973 31691889 MIR3 SINE/MIR 205756 6403667 6403976 6403816 AluJb SINE/Alu 205987 11206856 11207272 11207180 L2 LINE/L2 205988 11206856 11207272 11207172 L2 LINE/L2 206100 18869016 18869325 18869266 AluSx SINE/Alu 206441 9116810 9117124 9116945 L2 LINE/L2 206442 9116634 9116770 9116648 L2 LINE/L2 206527 19313875 19313992 19313960 MIR SINE/MIR 206528 19313584 19313795 19313769 MER33 DNA/MER1_type 206760 31052372 31052468 31052439 L2 LINE/L2 206833 32699070 32699169 32699162 MLT2B2 LTR/ERVL 207226 27162053 27162171 27162067 MIR SINE/MIR 207227 27162693 27162991 27162868 AluY SINE/Alu 207271 13300618 13300911 13300642 AluSp SINE/Alu 207354 11238197 11238390 11238268 MIR SINE/MIR 207415 19356999 19357410 19357292 LTR16A1 LTR/ERVL 207416 19356999 19357410 19357278 LTR16A1 LTR/ERVL 207996 28377325 28377419 28377389 AluJ/FLAM SINE/Alu 207997 28377179 28377311 28377299 MIR SINE/MIR 208423 26942719 26943029 26942975 AluJo SINE/Alu 208456 14553545 14553832 14553802 AluJo SINE/Alu 208457 14553545 14553832 14553800 AluJo SINE/Alu 208589 7111415 7111726 7111512 AluSq SINE/Alu 208617 8665833 8666135 8665983 AluSq SINE/Alu 208731 7879191 7879488 7879437 AluSx SINE/Alu 209131 29870531 29870842 29870674 AluSx SINE/Alu 209193 3897399 3897658 3897577 AluJb SINE/Alu 209197 32998330 32998665 32998571 MLT1B LTR/MaLR 209450 14434918 14435113 14435057 MIR SINE/MIR 209463 20944496 20944716 20944588 L2 LINE/L2 209645 33152924 33154023 33153774 L1MEd LINE/L1 209646 33154074 33154361 33154302 L1MA7 LINE/L1 209674 27665572 27665909 27665625 MER1B DNA/MER1_type 210090 34051619 34051911 34051787 AluY SINE/Alu 210092 34051619 34051911 34051624 AluY SINE/Alu 210519 28631320 28631628 28631334 AluSg SINE/Alu 210948 20885434 20885655 20885491 MIR SINE/MIR 211129 11239404 11239583 11239404 MIR SINE/MIR 211145 27012451 27012819 27012802 L2 LINE/L2 211162 28189954 28190256 28190104 AluSq SINE/Alu 211329 30976146 30976348 30976212 MER66A LTR/ERV1 211798 27998942 27999032 27999025 L1MB2 LINE/L1 211799 27999139 27999389 27999189 ERVL LTR/ERVL 211821 26944016 26944330 26944196 AluJo SINE/Alu 211822 26943760 26943907 26943852 FRAM SINE/Alu 211924 3818493 3818774 3818671 AluSc SINE/Alu 212252 15218351 15218663 15218575 AluJb SINE/Alu 212304 29474268 29474562 29474293 AluJb SINE/Alu 212400 13060515 13060926 13060754 MLT1C LTR/MaLR 212401 13061363 13061531 13061480 MIR SINE/MIR 212402 13061363 13061531 13061442 MIR SINE/MIR 212503 33003539 33003754 33003601 MIR SINE/MIR 212504 33003539 33003754 33003626 MIR SINE/MIR 212638 19950506 19950701 19950540 L1MEd LINE/L1 213076 26308734 26309045 26308770 AluSp SINE/Alu 213087 28388539 28388700 28388678 AluSc SINE/Alu 213088 28389219 28389704 28389357 MLT2E LTR/ERVL 213089 28389219 28389704 28389293 MLT2E LTR/ERVL 213090 28389014 28389157 28389148 AluSc SINE/Alu 213385 26496066 26496193 26496077 AluSg/x SINE/Alu 213544 11423363 11423657 11423600 AluSc SINE/Alu 213545 11423363 11423657 11423618 AluSc SINE/Alu 213697 16588556 16588768 16588701 MLT1A1 LTR/MaLR 213869 20250950 20251153 20251122 AluJo SINE/Alu 213949 1532527 1532689 1532533 MIR SINE/MIR 214035 19291091 19291390 19291292 AluSg1 SINE/Alu 214110 15870203 15870489 15870283 AluSx SINE/Alu 214911 1982001 1982165 1982012 MER47A DNA/MER2_type 215386 2755192 2755673 2755522 REP3 LTR/ERV 215679 23411880 23412209 23411958 AluSc SINE/Alu 215680 23411880 23412209 23411882 AluSc SINE/Alu 215848 20349790 20350099 20349982 AluSx SINE/Alu 215849 25795954 25796008 25795982 L2 LINE/L2 215912 29651924 29651975 29651942 T-rich Low_complexity 215998 28039409 28039738 28039484 MLT1G LTR/MaLR 216041 21884179 21884482 21884402 AluSx SINE/Alu 216388 31090542 31090798 31090711 L2 LINE/L2 216415 28514267 28514305 28514271 (TTA)n Simple_repeat 216416 28514533 28514608 28514533 L1M4 LINE/L1 216852 25469992 25470292 25470075 AluJb SINE/Alu 217065 33385617 33385787 33385625 (ATGGTG)n Simple_repeat 217282 16358885 16359296 16358899 L2 LINE/L2 217283 16358885 16359296 16358977 L2 LINE/L2 217668 31180278 31181521 31180345 L1ME LINE/L1 217678 33185953 33186259 33185994 MLT1A1 LTR/MaLR 217682 26304723 26304890 26304771 AluSp SINE/Alu 217812 1473644 1474044 1473811 L2 LINE/L2 217828 4141666 4141961 4141667 AluSc SINE/Alu 218672 6890035 6890334 6890241 AluJb SINE/Alu 218682 17391523 17391828 17391523 AluSx SINE/Alu 218946 1593170 1593467 1593415 AluSx SINE/Alu 219051 10677846 10677882 10677874 (CAAG)n Simple_repeat 219104 32475867 32475984 32475982 CT-rich Low_complexity 219251 9918781 9918918 9918877 MIR3 SINE/MIR 219286 11208630 11208736 11208722 MIR3 SINE/MIR 219332 26942352 26942552 26942525 MER20 DNA/MER1_type 219351 32168717 32168739 32168736 (TTTTG)n Simple_repeat 219352 32168338 32168630 32168556 AluY SINE/Alu 219363 9917872 9918255 9918103 MLT2A1 LTR/ERVL 219407 6936744 6937046 6936975 L1MEd LINE/L1 219408 6937051 6937239 6937052 L1MA1 LINE/L1 219409 6937302 6937980 6937343 L1PA13 LINE/L1 219501 23342382 23342564 23342535 L2 LINE/L2 219653 1535665 1535968 1535925 AluJo SINE/Alu 219780 4548180 4548274 4548211 (TA)n Simple_repeat 219963 1782988 1783302 1783253 AluSp SINE/Alu 220065 14881872 14882170 14882059 AluSc SINE/Alu 221771 17187346 17187625 17187528 AluY SINE/Alu 221772 17187346 17187625 17187596 AluY SINE/Alu 221916 9784358 9784418 9784394 (TCCC)n Simple_repeat 221923 24546717 24547027 24546777 AluY SINE/Alu 221924 24546717 24547027 24546825 AluY SINE/Alu 221925 24553415 24553705 24553553 AluSx SINE/Alu 221938 15494632 15494668 15494633 (TCTA)n Simple_repeat 221939 15494632 15494668 15494648 (TCTA)n Simple_repeat 221941 15498558 15498786 15498766 L1MEc LINE/L1 221942 15498899 15499292 15499009 L1MEc LINE/L1 221950 12666197 12666369 12666286 AluSx SINE/Alu 221956 12525302 12525346 12525303 (TA)n Simple_repeat 221967 12540345 12540649 12540356 AluSg SINE/Alu 222281 7782938 7783354 7783059 MLT1A1 LTR/MaLR 222315 34305123 34305205 34305141 AluJ/FLAM SINE/Alu 222342 17708523 17708680 17708526 MIR SINE/MIR 222348 20441662 20441959 20441881 AluSc SINE/Alu 222349 16657118 16657389 16657356 MER20B DNA/MER1_type 222357 27854569 27854637 27854612 Tigger2 DNA/MER2_type 222358 27854569 27854637 27854613 Tigger2 DNA/MER2_type 222359 27854942 27855135 27854965 Tigger2 DNA/MER2_type 222360 16953876 16954010 16953994 L2 LINE/L2 222371 24045392 24045693 24045413 AluY SINE/Alu 222372 24045392 24045693 24045674 AluY SINE/Alu 222373 24050632 24050874 24050671 HsTC2 DNA/Tc2 222383 10803509 10803709 10803514 MIR SINE/MIR 222384 10957831 10958663 10958094 L1MB3 LINE/L1 222428 6440336 6440753 6440400 L1ME3 LINE/L1 222733 1597979 1598283 1598027 AluSx SINE/Alu 222734 1598821 1599130 1598861 AluSq SINE/Alu 222735 1598821 1599130 1599094 AluSq SINE/Alu 222739 1778236 1778530 1778390 AluY SINE/Alu 222740 1778236 1778530 1778474 AluY SINE/Alu 227415 11255783 11255896 11255790 MER5B DNA/MER1_type 227431 29264907 29265610 29264974 L2 LINE/L2 227432 29264907 29265610 29265182 L2 LINE/L2 227433 29264907 29265610 29265313 L2 LINE/L2 227434 13031973 13032095 13032037 L1ME4a LINE/L1 227435 13032161 13032458 13032415 AluSx SINE/Alu 227436 13032161 13032458 13032421 AluSx SINE/Alu 227449 28407167 28408038 28407182 L1ME2 LINE/L1 227574 8884180 8884535 8884480 L1MB7 LINE/L1 228610 8483748 8484051 8483817 AluY SINE/Alu 228611 6929184 6929437 6929374 HUERS-P2 LTR/ERV1 228622 19642 20323 19783 L1PA15-16 LINE/L1 228701 6742483 6743121 6743066 MER4B LTR/ERV1 228766 18831696 18831912 18831764 MIR SINE/MIR 228774 16043299 16043561 16043472 L1MB7 LINE/L1 228775 26154293 26154358 26154315 L1MB7 LINE/L1 228813 10434894 10435202 10435194 AluSq SINE/Alu 228814 10434894 10435202 10435195 AluSq SINE/Alu 228815 10435868 10436164 10436074 L1MC4a LINE/L1 228816 10435868 10436164 10436088 L1MC4a LINE/L1 228817 10436165 10436466 10436272 AluJb SINE/Alu 228818 25761329 25761518 25761374 MIR SINE/MIR 228819 25761329 25761518 25761435 MIR SINE/MIR 228820 25761329 25761518 25761448 MIR SINE/MIR 228821 25761588 25761754 25761710 L2 LINE/L2 228894 13398624 13398727 13398684 MIR SINE/MIR 228904 3215006 3215611 3215129 L1MCa LINE/L1 228906 3800121 3800435 3800167 AluSx SINE/Alu 228907 3800121 3800435 3800333 AluSx SINE/Alu 228908 3800478 3801463 3800547 LTR13 LTR/ERVK 229195 13949222 13949514 13949401 AluSx SINE/Alu 229420 2934462 2934586 2934576 L1MB8 LINE/L1 229748 15692273 15692520 15692399 MIR SINE/MIR 230008 4345486 4345978 4345863 HERVL74 LTR/ERVL 230639 1514716 1515004 1514997 AluJb SINE/Alu 230980 4038348 4038613 4038513 AluJo SINE/Alu 233930 2619852 2620148 2620121 AluSc SINE/Alu 238440 18090096 18090374 18090372 AluSc SINE/Alu 240292 25367681 25368052 25368029 L1MC4a LINE/L1 240293 25367681 25368052 25368027 L1MC4a LINE/L1 242300 22612978 22613099 22613092 L2 LINE/L2 242316 23427460 23427938 23427852 MLT1K LTR/MaLR 242319 31960843 31962019 31961526 L1MDa LINE/L1 242401 29316319 29316436 29316323 MIR SINE/MIR 242403 13049770 13050292 13049893 L2 LINE/L2 242404 13049770 13050292 13050002 L2 LINE/L2 242405 13049770 13050292 13050211 L2 LINE/L2 242421 18551457 18551487 18551465 AT_rich Low_complexity 242429 16330321 16330615 16330455 AluJo SINE/Alu 242430 16283364 16283650 16283580 AluSg SINE/Alu 242457 26949803 26950227 26949942 HAL1 LINE/L1 242469 11617135 11617516 11617454 L2 LINE/L2 242470 28422642 28423030 28422925 L2 LINE/L2 242480 28073787 28074231 28074224 L1MC/D LINE/L1 242511 10307769 10307932 10307846 MIR SINE/MIR 242649 28031280 28031526 28031395 L1MB3 LINE/L1 242650 28031280 28031526 28031487 L1MB3 LINE/L1 242653 30276383 30276680 30276439 AluSq SINE/Alu 242741 20410170 20410702 20410194 L2 LINE/L2 242848 27761562 27761698 27761584 MIR SINE/MIR 243019 19479216 19479455 19479309 (TG)n Simple_repeat 243024 8817067 8817276 8817146 L1ME LINE/L1 243110 11471131 11471312 11471286 L2 LINE/L2 243111 11465689 11465789 11465706 MIR3 SINE/MIR 243112 11453597 11454079 11453747 MLT1E LTR/MaLR 243113 11453597 11454079 11453735 MLT1E LTR/MaLR 243114 11453597 11454079 11453718 MLT1E LTR/MaLR 243115 11450181 11450362 11450201 MIR SINE/MIR 243265 15323811 15324110 15324103 AluJb SINE/Alu 243270 30910176 30910535 30910333 THE1B LTR/MaLR 243409 31503592 31504873 31503738 ERVL LTR/ERVL 243410 31503592 31504873 31503760 ERVL LTR/ERVL 243411 31503592 31504873 31503849 ERVL LTR/ERVL 243446 27364058 27364253 27364224 L2 LINE/L2 245812 7436986 7437026 7436992 (CA)n Simple_repeat 245816 8541861 8542305 8542134 HAL1 LINE/L1 245817 6890876 6891462 6891028 LTR9 LTR/ERV1 245818 6890876 6891462 6891361 LTR9 LTR/ERV1 245863 18379 19163 19077 L1PA15-16 LINE/L1 245864 18379 19163 19141 L1PA15-16 LINE/L1 245873 158863 159154 158901 AluJb SINE/Alu 245875 161865 161966 161939 L2 LINE/L2 245880 226228 226333 226265 U6 snRNA 245881 201045 201700 201110 MER4-int LTR/ERV1 245882 201045 201700 201116 MER4-int LTR/ERV1 245883 201045 201700 201164 MER4-int LTR/ERV1 245897 1468431 1468735 1468431 MER113 DNA/MER1_type? 245991 6113839 6113958 6113900 MLT1A1 LTR/MaLR 245992 6113839 6113958 6113933 MLT1A1 LTR/MaLR 245993 6113839 6113958 6113947 MLT1A1 LTR/MaLR 246163 18112980 18113807 18113626 L1MEc LINE/L1 246164 18090096 18090374 18090321 AluSc SINE/Alu 246165 18220528 18220828 18220725 AluSq SINE/Alu 246206 33139439 33139744 33139513 AluSx SINE/Alu 246209 18851054 18851143 18851123 L2 LINE/L2 246224 20550921 20551030 20550945 MIR SINE/MIR 246226 21467518 21467573 21467533 (CCCCAG)n Simple_repeat 246228 16968701 16968937 16968870 MER20 DNA/MER1_type 246268 8106333 8106620 8106381 AluSx SINE/Alu 246289 20050122 20050283 20050162 MIR SINE/MIR 246309 27567907 27568025 27567977 L2 LINE/L2 246310 27741095 27741221 27741135 MIR SINE/MIR 246328 21679220 21679406 21679296 MER58A DNA/MER1_type 246338 16784899 16785226 16785074 L1ME1 LINE/L1 246339 16821307 16821811 16821590 MLT2B3 LTR/ERVL 246374 19039999 19040300 19040068 AluSx SINE/Alu 247233 17157240 17157545 17157438 AluSg SINE/Alu 247259 27929802 27930073 27929829 AluYa5 SINE/Alu 247513 34458539 34458717 34458585 (CGTG)n Simple_repeat 247744 15632341 15632640 15632633 AluSc SINE/Alu 248079 4667037 4667346 4667202 AluY SINE/Alu 248080 4667520 4667753 4667602 L1MCa LINE/L1 248081 4667520 4667753 4667605 L1MCa LINE/L1 248082 4667520 4667753 4667606 L1MCa LINE/L1 252732 10996549 10996861 10996691 MLT1L LTR/MaLR 252733 10996549 10996861 10996824 MLT1L LTR/MaLR 252734 10997148 10997437 10997284 AluY SINE/Alu 252735 10997148 10997437 10997346 AluY SINE/Alu 252737 11115810 11116302 11116243 L1ME3 LINE/L1 252738 11116324 11116444 11116337 MIR SINE/MIR 252756 11315887 11316570 11316539 MER50 LTR/ERV1 252785 23347625 23347927 23347727 L2 LINE/L2 252786 23347625 23347927 23347795 L2 LINE/L2 252808 18703551 18704181 18703619 L1PA8 LINE/L1 252809 18703551 18704181 18704028 L1PA8 LINE/L1 252810 18704343 18704407 18704396 L2 LINE/L2 252811 18704343 18704407 18704397 L2 LINE/L2 252842 11870054 11870645 11870427 Tigger2 DNA/MER2_type 252878 11198181 11198446 11198350 L2 LINE/L2 253017 28834908 28835026 28834996 L3 LINE/CR1 253031 32452517 32452942 32452584 HAL1 LINE/L1 254046 8753316 8753580 8753472 AluY SINE/Alu 254053 185960 186426 186326 L1P4 LINE/L1 254058 245896 246095 246038 L1M3 LINE/L1 254059 245896 246095 246063 L1M3 LINE/L1 254060 252578 252833 252648 AluSg SINE/Alu 254061 25283